Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  273  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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1.91
Indices
Period
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Copy
Number
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Size
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Indels
Score
A
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1.95
89562754--89562910
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78
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29
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1.99
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216
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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6.6
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214
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28
14
26
1.95
89617977--89618132
82
1.9
81
89
3
242
30
28
14
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1.95
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4.1
21
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3
2
38
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89672841--89672945
41
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18
21
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1.97
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26
93
0
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0
1
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11
70
26
72
37
1
3
57
1.22
89695751--89695831
19
4.1
20
90
6
112
38
1
3
56
1.25
89695788--89695835
15
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15
84
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0
0
58
0.98
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15
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20
34
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89701781--89701863
26
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19
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1.98
89701781--89701850
25
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26
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27
21
22
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1.99
89704902--89704950
22
2.3
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51
18
0
30
1.47
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1.95
89725271--89725313
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2
0
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1.13
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2
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1.00
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1.97
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1.87
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1.8
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1.99
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27
20
22
1.98
89746403--89746545
46
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45
71
15
105
30
26
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.40
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23
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15
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24
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1.9
118
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16
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0
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0
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1.54
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35
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25
22
1.95
89773140--89773337
108
1.8
110
86
4
294
34
15
25
23
1.95
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16
1.9
16
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0
53
41
0
22
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1.54
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1.98
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2.0
40
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2.3
74
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1
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30
19
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28
1.97
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0
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1.53
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19
0
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2.1
28
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23
0
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1.47
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14
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0
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1.45
89782178--89782236
21
2.8
21
78
0
64
16
1
35
45
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89782349--89782383
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14
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0
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7
14.6
7
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12
0
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2.7
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0
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0
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0
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4.3
39
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0
223
23
25
19
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356