Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   

This is table  310  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100787843--100788482
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2.6
248
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2.0
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2.2
40
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3
51
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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0
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100816241--100816311
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3.1
21
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15
70
56
1
0
42
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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33
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1
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1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.03
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1.11
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2.8
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15
21
18
44
1.86
100896492--100896535
22
2.0
22
100
0
88
22
22
13
40
1.89
100901977--100902014
18
2.2
18
85
4
51
13
26
5
55
1.59
100903839--100903902
6
10.2
6
75
6
56
1
20
3
75
1.03
100907699--100907742
18
2.4
18
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7
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45
2
4
47
1.35
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7
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7
100
0
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0
28
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0
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0
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0
0
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0
5
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0
2
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1.84
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0
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20
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3
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1
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100938953--100939012
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40
0
18
1.51
100939626--100939788
22
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21
72
11
98
40
38
0
20
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
1.51
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0
20
1.52
100939731--100939785
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15
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43
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0
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1.53
100939614--100939785
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11.9
14
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0
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0
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2.0
207
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0
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0
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0
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1.33
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1
22
1.17
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0
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66
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3
24
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15
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4
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13
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9
36
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290
28
23
16
32
1.95
100977441--100977816
132
2.8
132
88
1
545
28
22
16
32
1.96
100977804--100977888
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1.9
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4
136
29
29
14
27
1.95
100977820--100977907
44
2.0
44
91
4
142
29
28
14
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100977928--100978742
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87
2
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22
22
22
32
1.98
100977928--100978742
255
3.2
253
86
3
1145
22
22
22
32
1.98
100977928--100978743
171
4.8
171
89
1
1217
22
22
22
32
1.98
100979685--100979744
13
4.5
13
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10
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3
11
0
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0.72
100979687--100979742
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3
12
0
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0.76
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17
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1
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1.61
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21
3.0
21
70
14
60
66
6
4
23
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356