Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  7  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2413528--2413631
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45
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3
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2.4
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23
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1.93
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2.0
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1.9
15
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6
0
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1.9
14
100
0
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3
51
1.48
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2.7
131
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23
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2.0
22
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22
1.9
22
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0
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0
0
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0
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0
0
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2.0
27
100
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18
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1.76
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6.5
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89
10
64
17
0
2
80
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2507742--2507779
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13
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60
18
0
2
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4
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0
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0
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1.00
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2.0
19
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60
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4
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0
0
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3
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1.32
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21
3.2
21
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21
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2.2
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22
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20
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35
3.0
35
97
0
199
17
50
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21
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15.3
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0
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0
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43
0
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5.1
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7
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33
15
19
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1.93
2553613--2553985
144
2.6
141
82
6
467
32
15
19
32
1.92
2572925--2572972
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2.0
24
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11
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6
12
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24
3.0
22
82
8
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46
0
3
50
1.16
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21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
62
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1
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14
7
48
1.72
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553
4.0
553
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0
4421
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12
28
1.92
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20
2.0
21
85
14
57
75
5
2
17
1.10
2611228--2611282
24
2.3
25
84
9
71
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3
5
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1.44
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41
2.1
41
97
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161
38
12
7
41
1.71
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29
2.7
30
76
12
80
45
8
6
39
1.59
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49
4.9
50
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4
289
26
18
27
28
1.98
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92
2.5
87
80
13
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22
8
29
1.84
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2.0
21
86
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18
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20
62
30
1
2
66
1.13
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1.9
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31
1
3
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29
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50
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18
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22
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1
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1.20
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19
2.3
18
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11
52
38
0
4
56
1.20
2657312--2657351
16
2.3
19
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12
59
37
2
2
57
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2657312--2657447
10
14.6
9
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24
52
31
2
4
61
1.31
2657796--2657822
7
3.9
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100
0
54
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0
0
14
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2.4
16
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12
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31
0
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1.25
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15
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63
55
0
0
44
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0
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0
0
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0
0
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11
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18
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72
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0
27
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2.2
33
100
0
144
50
0
11
38
1.38
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31
2.0
31
87
6
92
38
7
9
44
1.66
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12
2.2
12
100
0
52
80
0
19
0
0.71
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10
3.5
10
88
4
52
52
0
0
47
1.00
2678420--2678491
30
2.4
30
93
2
119
38
8
8
44
1.65
2682909--2682990
37
2.2
37
81
12
98
50
0
8
41
1.33
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43
1.9
43
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0
110
57
7
3
31
1.44
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3
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100
0
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0
31
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17
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17
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25
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50
1.39
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19
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0
0
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2
0
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1.12
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22
3.0
24
77
14
83
58
2
0
38
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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24
0
8
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7
3.7
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0
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0
15
26
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19
2.0
20
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5
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60
7
2
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1.38
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33
2.0
33
84
0
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29
20
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12
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33
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1.95
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25
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0
100
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30
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2.0
18
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5
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33
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2
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30
11
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1.70
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12
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0
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1.9
129
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2.0
42
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1.58
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18
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18
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0
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26
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1.63
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129
2.3
126
85
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361
21
52
5
20
1.67
2753070--2753132
21
3.0
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22
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26
53
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27
2.8
24
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28
52
5
12
1.62
2758718--2758918
106
1.9
106
93
0
348
30
19
20
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2759410--2759453
18
2.3
20
81
18
58
52
0
15
31
1.44
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44
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6
240
29
26
15
27
1.96
2761579--2762223
132
5.0
132
78
9
569
29
26
16
27
1.97
2761745--2761972
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2.0
113
94
0
402
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25
16
27
1.97
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8.1
45
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433
30
25
16
26
1.97
2761883--2762223
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3.9
88
89
1
529
30
25
17
26
1.97
2761895--2762218
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2.4
131
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396
30
25
17
26
1.97
2761883--2762223
178
1.9
176
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1
529
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25
17
26
1.97
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0
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0
0
100
0.00
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1.9
106
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0
348
30
19
20
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356