Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  185  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59883551--59883603
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2.2
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19
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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1.85
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141
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478
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.12
60093982--60094055
7
10.4
7
76
2
58
51
29
0
18
1.47
60093982--60094055
21
3.5
21
77
1
76
51
29
0
18
1.47
60094070--60094247
95
1.9
95
84
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241
26
25
21
26
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22
2.0
22
90
4
68
61
2
0
35
1.09
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20
2.5
20
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0
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55
4
8
32
1.48
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14
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15
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57
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28
1.34
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12
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12
100
0
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0
0
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0.99
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31
2.0
31
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17
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1.66
60141866--60141926
18
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18
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17
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1
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1.33
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19
2.0
19
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0
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1.78
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21
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21
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0
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1.51
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36
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0
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16
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16
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49
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0
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30
16
18
34
1.93
60169452--60169500
18
2.7
18
90
3
71
36
4
12
46
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60171203--60171243
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2.4
17
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4
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29
4
9
56
1.53
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19
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19
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3
0
41
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27
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27
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28
29
1.96
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82
1.9
81
88
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233
26
15
28
29
1.96
60174621--60174801
82
2.2
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2
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27
15
27
29
1.96
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40
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25
21
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25
1.99
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1.99
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25
1.99
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80
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25
21
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2.0
20
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2
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23
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1.96
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42
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28
20
24
26
1.99
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2.1
34
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0
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15
2
32
1.60
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24
2.0
24
100
0
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0
28
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30
28
18
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1.97
60235970--60236140
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1.8
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261
30
28
18
22
1.98
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1
140
25
14
28
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1.95
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25
28
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2.1
37
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0
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25
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18
25
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10.1
49
92
2
763
28
30
8
31
1.88
60266157--60266640
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5.0
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31
1.88
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40
6.6
40
84
4
291
23
26
23
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60270083--60270358
80
3.5
80
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324
24
26
22
26
2.00
60270663--60270741
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
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2.1
37
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0
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25
1.98
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9.0
49
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691
28
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9
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1.88
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2.0
33
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1.81
60282203--60282239
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3.1
12
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2.0
64
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211
30
18
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0
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27
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223
3.0
221
81
8
684
29
19
21
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356