Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  123  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39167615--39167678
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28
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28
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4
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2.3
35
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2
26
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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28
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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76
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
29
1.98
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2.8
48
82
4
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31
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26
1.97
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26
2.0
26
92
0
88
52
16
13
16
1.74
39377168--39377219
8
6.5
8
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0
50
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25
15
1.85
39377161--39377219
24
2.5
24
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0
82
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23
15
1.84
39377165--39377221
16
3.6
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0
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24
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39377443--39377555
58
2.0
57
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26
14
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0
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29
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25
1.95
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2.1
87
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1.70
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24
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20
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25
2.3
25
100
0
116
20
15
6
56
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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23
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48
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28
28
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1.97
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95
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28
28
16
26
1.97
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144
1.9
144
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1.97
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28
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1.97
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25
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24
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0
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0
1
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5.7
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404
49
15
1
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1
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2.6
61
87
4
237
46
17
0
35
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39440368--39440393
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2.2
12
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0
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2.0
43
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0
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17
25
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1.8
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22
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1.98
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22
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2
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1.63
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2.5
22
79
8
58
22
1
27
48
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356