Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  27  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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2.9
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10
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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52
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0
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120
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4
1
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1.32
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2.0
43
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2
1
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0
29
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9403776--9403826
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93
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26
0
26
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1.52
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2.1
21
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0
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28
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20
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2
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4
52
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19
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2
9
34
1.47
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65
2.9
65
82
3
218
20
19
24
35
1.95
9421965--9422003
20
2.0
20
89
0
60
48
5
7
38
1.54
9426239--9426283
19
2.4
19
85
7
56
53
8
0
37
1.32
9431973--9432006
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
9440142--9440193
24
2.1
25
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3
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42
3
9
44
1.55
9445329--9445364
13
2.6
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13
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0
16
0
0.65
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2.1
23
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0
60
27
2
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64
1.28
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36
2.0
36
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2
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30
22
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9467288--9467313
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12
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0
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69
1.14
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2
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0
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2.0
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1.66
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15
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25
2.6
25
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0
87
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17
20
17
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19
2.2
19
100
0
82
65
4
4
24
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
100
0
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22
4
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165
2.0
165
100
0
664
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18
15
28
1.91
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19
2.7
19
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3
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23
19
17
39
1.92
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6
6.5
6
83
10
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0
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2.0
20
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0
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0
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1.82
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3
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1
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1.32
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2.2
60
80
6
147
33
5
1
59
1.30
9518243--9518426
60
3.1
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5
212
29
7
1
61
1.32
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0
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0
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0
1.00
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28
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2.3
224
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0
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20
29
1.97
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180
1.8
182
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4
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30
18
20
30
1.96
9527658--9528261
224
2.7
224
89
2
775
31
18
20
29
1.97
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2
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3
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17
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37
0
1
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1.05
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20
3.0
22
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75
40
0
1
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1.07
9532254--9532320
26
2.6
26
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66
37
0
1
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1.05
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2.8
14
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0
7
15
1.01
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45
2.7
44
85
3
161
21
20
19
38
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9533790--9533824
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1.9
18
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0
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17
25
17
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1.90
9539821--9539931
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3.0
37
72
18
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38
1
2
56
1.24
9539881--9539937
20
2.8
20
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15
71
42
1
1
54
1.21
9539872--9539920
25
1.9
26
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4
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38
2
0
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2.7
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3
161
21
20
19
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1.94
9541387--9541421
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1.9
18
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0
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0
0
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2.5
119
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2
493
42
2
4
50
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356