Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  336  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107922459--107922500
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0
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0
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26
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10
26
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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23
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2
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107991640--107991691
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1
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2
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3
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107991931--107992014
27
3.2
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12
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3
35
1.28
107991894--107992013
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2.0
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34
1.37
107992021--107992066
25
1.9
25
86
8
69
60
0
4
34
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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2.1
17
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5
54
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5
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1.43
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1.95
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65
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1
30
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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25
17
8
48
1.74
108008116--108008422
89
3.5
89
69
13
254
30
16
25
26
1.97
108008092--108008578
177
2.8
176
89
0
735
30
16
26
26
1.97
108008515--108008700
44
4.3
43
73
7
137
31
19
24
24
1.98
108008828--108009220
88
4.5
88
86
0
543
33
21
23
21
1.97
108008829--108009220
177
2.2
176
89
0
595
33
21
23
21
1.98
108009061--108009244
44
4.2
43
71
13
142
34
20
20
24
1.96
108009374--108009621
44
5.7
44
72
6
182
31
20
21
26
1.98
108010895--108011083
3
62.3
3
69
18
90
29
5
4
60
1.37
108011039--108011094
27
2.2
25
84
12
69
23
7
0
69
1.12
108011790--108011833
23
2.0
22
86
4
61
38
11
6
43
1.67
108014385--108014511
68
1.9
67
93
4
220
34
16
8
40
1.79
108016227--108016565
174
1.9
175
85
1
464
28
16
18
35
1.93
108017880--108018012
18
7.5
18
84
5
182
40
11
12
36
1.78
108017871--108018012
35
4.0
35
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2
221
40
10
12
36
1.78
108018496--108018555
17
3.5
17
74
21
63
33
1
0
65
1.03
108018497--108018555
16
3.5
16
76
23
59
33
1
0
64
1.04
108018532--108018581
26
1.9
26
83
0
64
36
4
0
60
1.16
108022010--108022065
22
2.6
22
83
5
62
73
7
0
19
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108022020--108022049
15
1.9
16
93
6
53
73
6
0
20
1.05
108022019--108022052
15
2.2
15
84
5
50
76
5
0
17
0.98
108022693--108022743
22
2.3
22
80
6
59
33
0
3
62
1.13
108022786--108022826
17
2.4
17
83
0
55
36
4
2
56
1.34
108022767--108022856
31
2.9
30
80
14
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32
6
4
56
1.45
108022593--108022856
3
86.3
3
67
14
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29
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4
60
1.39
108022847--108023504
144
4.7
141
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14
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30
3
5
60
1.36
108022847--108023494
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2.3
273
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30
3
5
60
1.37
108023109--108023409
14
19.4
16
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31
3
4
61
1.32
108023259--108023301
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1.9
22
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13
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32
0
9
58
1.30
108023260--108023308
23
2.2
22
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10
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32
0
10
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1.32
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2.1
18
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0
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37
2
2
56
1.28
108023110--108023504
141
2.8
137
86
9
501
31
3
4
60
1.33
108025969--108026009
18
2.3
18
86
0
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4
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17
1.69
108028748--108028787
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3.2
13
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7
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10
10
2
77
1.08
108029662--108029686
8
3.1
8
100
0
50
48
0
0
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1.00
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19
2.0
19
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10
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50
2
5
42
1.39
108030702--108030764
30
2.1
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3
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49
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15
20
1.80
108031891--108031959
9
7.7
9
83
0
84
24
4
18
52
1.64
108031891--108031959
27
2.6
27
85
0
93
24
4
18
52
1.64
108035115--108035139
13
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13
100
0
50
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0
8
24
1.16
108039252--108039317
10
7.0
9
74
14
53
37
3
1
57
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108041797--108041879
37
2.2
37
95
4
150
45
15
15
22
1.84
108042550--108042599
24
2.1
24
85
7
66
32
4
6
58
1.41
108042992--108043058
21
3.1
22
81
12
68
55
1
2
40
1.24
108045871--108045924
23
2.4
23
78
6
58
59
0
3
37
1.15
108045992--108046024
16
2.0
17
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50
45
0
0
54
0.99
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113
61
0
2
35
1.10
108047014--108047056
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2.3
19
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0
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28
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1
1
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1.21
108047058--108047111
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2.0
27
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3
1
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1.27
108048737--108048770
9
3.6
9
85
14
50
44
0
11
44
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356