Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  58  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18767232--18767263
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16
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2.2
32
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0
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1600
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29
1.87
18804620--18805465
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1408
32
8
29
29
1.87
18804620--18805465
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1420
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1.01
18828062--18828123
23
2.6
24
82
10
74
72
1
1
24
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18828154--18828188
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0
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3
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16
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4
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32
1.46
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1.40
18843893--18844017
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22
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0
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0
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0.94
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2.2
17
100
0
74
24
37
27
10
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18859143--18859186
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0
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2.7
23
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25
19
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22
8
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1.26
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0
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11
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0
0
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18900757--18900798
22
2.0
21
86
9
59
28
0
2
69
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18909710--18909734
11
2.3
11
100
0
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20
16
16
48
1.82
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19
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3
71
35
2
14
47
1.56
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18
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0
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1.21
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19
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20
73
42
0
1
56
1.07
18935483--18935556
21
3.7
20
81
13
82
43
0
1
55
1.08
18935488--18935556
19
3.5
20
84
15
83
44
0
0
55
0.99
18935637--18935674
11
3.1
12
85
14
51
36
0
2
60
1.11
18935694--18935772
17
4.2
19
79
12
81
54
0
1
44
1.08
18935720--18935815
22
4.3
22
77
14
90
52
0
0
47
1.00
18935727--18935816
23
3.9
23
80
12
96
51
0
0
48
1.00
18941525--18941569
23
2.1
21
84
15
58
55
0
6
37
1.26
18941552--18941596
21
2.1
21
84
8
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60
4
4
31
1.37
18944677--18944747
37
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37
100
0
142
23
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19
23
1.98
18944893--18945076
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4
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30
26
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36
1.83
18944893--18945077
48
3.8
48
90
4
300
30
25
7
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1.83
18944893--18945205
94
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28
27
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1.88
18944999--18945240
47
5.1
47
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3
283
28
28
9
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1.88
18945140--18945211
22
3.1
22
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24
58
25
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1.92
18952710--18952749
21
1.9
21
84
0
53
32
12
15
40
1.84
18959334--18959407
23
3.3
23
72
11
62
40
21
16
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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28
28
22
1.98
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27
1.9
27
92
0
86
26
30
19
23
1.98
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15
2.7
15
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3
57
21
21
30
26
1.98
18960370--18960467
46
2.1
47
88
1
144
46
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15
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54
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1.60
18970529--18970572
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2.1
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0
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126
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0
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0
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0
0
36
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2.2
21
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0
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14
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1.74
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21
2.2
21
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0
58
10
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1.84
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30
2.3
30
84
0
102
8
20
42
28
1.82
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11
2.3
11
100
0
50
72
0
0
28
0.86
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2
0
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2.0
615
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0
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2.0
29
100
0
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31
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1.64
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2.5
23
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7
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1.24
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25
2.5
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0
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1.29
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3.0
23
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0
5
29
1.17
18993675--18993791
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4.0
28
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21
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64
0
8
26
1.28
18993728--18993773
15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18993753--18993793
14
2.8
15
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50
60
0
9
29
1.28
18993728--18993788
15
4.1
14
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0
6
26
1.15
18997012--18997146
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2.6
52
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173
28
14
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46
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28
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13
100
0
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16
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2
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2
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21
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4
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1.54
19003758--19003819
30
2.0
31
84
3
81
29
11
3
56
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356