Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  82  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.81
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15
5.2
15
67
11
61
24
21
8
44
1.81
26005339--26005399
29
2.1
29
84
3
79
34
8
8
49
1.62
26016165--26016230
28
2.4
28
97
0
123
40
15
9
34
1.78
26024781--26024839
28
2.1
27
84
3
73
15
20
25
38
1.91
26034863--26034898
17
2.1
17
100
0
72
52
11
5
30
1.59
26035506--26035543
20
1.9
20
88
0
58
34
5
7
52
1.53
26039698--26039748
16
3.2
16
88
0
84
39
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37
19
1.70
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19
2.1
20
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4
57
46
4
0
48
1.23
26043477--26043530
19
2.7
20
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8
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48
7
0
44
1.31
26062850--26062895
23
2.0
23
100
0
92
21
39
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21
1.93
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22
2.1
22
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4
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40
0
4
55
1.20
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30
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30
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5
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40
1.34
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23
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18
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10
22
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15
2.1
15
93
0
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16
0
0
83
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20
2.2
23
75
24
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22
18
20
38
1.93
26074005--26074047
20
2.2
20
100
0
86
20
16
23
39
1.92
26074381--26074453
35
2.0
35
81
5
83
31
20
20
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26074390--26074461
35
2.1
34
84
2
90
26
23
23
26
2.00
26075399--26075432
14
2.5
14
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4
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14
8
0
76
1.01
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146
1.9
145
82
4
352
31
23
14
31
1.94
26094031--26094196
61
2.7
60
77
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28
25
15
29
1.96
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5.5
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28
12
27
1.93
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53
2.8
53
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0
199
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26
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32
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2.1
30
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49
0
2
47
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3
15.7
3
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56
2
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35
1.36
26101274--26101321
18
2.6
18
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56
2
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35
1.36
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13
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19
55
66
1
3
27
1.19
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2.0
21
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70
0
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22
1.11
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18
2.0
18
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54
54
5
2
37
1.39
26102924--26103174
89
2.8
88
80
9
255
29
17
18
34
1.94
26102883--26103171
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2.2
133
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7
331
29
18
18
34
1.95
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44
16.6
44
68
13
293
29
18
17
35
1.93
26103240--26103410
45
3.7
44
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108
29
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16
37
1.91
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4.0
96
76
5
353
28
17
16
37
1.92
26108589--26108853
93
2.8
93
95
0
467
27
27
21
23
1.99
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46
77
11
289
28
27
20
23
1.99
26114176--26114348
46
3.8
45
80
11
190
28
28
20
22
1.99
26114230--26114402
47
3.7
47
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228
29
28
19
23
1.98
26114184--26114398
93
2.3
93
93
0
358
28
28
20
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26123839--26123878
21
1.9
21
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10
55
70
0
7
22
1.12
26123896--26123933
18
2.1
18
85
14
51
71
0
5
23
1.07
26124734--26124796
28
2.2
28
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8
74
7
7
12
71
1.31
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100
0
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68
0
0
31
0.90
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0
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23
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2.0
22
90
0
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18
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0
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0
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17
2.1
17
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0
54
66
0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356