Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  231  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76001897--76002150
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2.0
128
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2
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0
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1.9
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28
15
26
1.96
76014889--76015065
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3.3
54
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6
196
29
28
15
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1.96
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2
844
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85
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14
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1.86
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2.0
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2.0
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2
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0
54
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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8.3
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988
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29
29
1.86
76081409--76081906
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3.4
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29
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2.0
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2.0
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6.0
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30
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1
473
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28
26
1.99
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1
479
24
21
28
25
1.99
76084454--76084772
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8
29
29
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76088203--76088662
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3.2
145
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29
29
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100
0
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2.4
28
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2.2
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20
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21
2.7
21
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55
20
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6.0
11
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13
50
76
1
2
19
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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162
24
17
30
27
1.97
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2.0
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1
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29
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2
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1.14
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2.6
31
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2
0
48
1.15
76184217--76184308
45
2.2
38
77
22
121
47
2
0
50
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76191316--76191349
17
2.1
16
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5
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0
8
1.01
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43
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0
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22
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2.1
21
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59
4
15
2
76
1.06
76202638--76202697
26
2.3
26
85
5
77
3
15
3
78
1.01
76202657--76202697
20
2.0
20
90
0
64
2
12
2
82
0.86
76202652--76202704
25
2.1
25
89
6
81
3
13
1
81
0.92
76209369--76209463
40
2.4
40
94
0
163
30
29
18
21
1.97
76215371--76215414
21
2.1
21
83
8
54
43
11
9
36
1.72
76217505--76217534
15
2.0
15
100
0
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13
13
0
73
1.10
76217701--76217732
16
1.9
17
93
6
57
59
6
0
34
1.23
76218401--76218439
19
2.1
19
100
0
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5
5
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1.45
76220106--76220136
14
2.2
14
100
0
62
16
6
0
77
0.97
76220119--76220163
20
2.3
20
88
3
65
26
2
0
71
0.98
76222359--76222432
32
2.3
33
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4
116
22
18
8
50
1.74
76235232--76235359
29
4.5
28
80
4
139
24
11
22
41
1.87
76235233--76235359
58
2.2
57
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4
157
24
11
22
40
1.87
76239762--76239942
80
2.2
81
88
2
267
28
23
8
39
1.85
76239762--76239942
27
6.7
27
85
1
265
28
23
8
39
1.85
76239918--76240048
54
2.4
54
84
2
156
43
20
6
29
1.76
76239950--76240074
27
4.6
27
80
3
117
43
20
7
28
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76239762--76240011
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1.9
134
82
1
322
34
22
8
36
1.83
76240033--76240229
27
7.3
27
86
1
234
36
21
18
23
1.95
76240630--76240700
31
2.3
31
95
0
124
21
15
15
47
1.82
76240630--76240742
6
18.3
6
69
18
63
21
17
14
46
1.83
76244537--76244768
49
4.7
49
82
7
288
28
27
18
25
1.98
76244586--76244766
100
1.8
101
88
1
283
29
26
18
25
1.98
76247540--76247572
15
2.2
15
94
0
57
57
12
12
18
1.64
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3.5
49
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3
249
29
25
18
25
1.98
76250666--76250848
100
1.8
100
95
0
330
28
26
19
25
1.99
76253003--76253233
95
2.4
95
88
0
327
24
28
20
26
1.99
76253010--76253237
45
4.7
50
76
10
215
25
28
19
26
1.98
76259265--76259510
50
5.0
49
84
5
293
25
29
18
26
1.98
76262973--76263234
39
6.6
39
84
5
293
25
22
26
25
2.00
76263025--76263265
78
3.1
79
82
6
215
26
21
26
25
2.00
76274688--76274864
27
6.5
27
81
3
185
30
26
15
27
1.96
76274708--76274863
82
1.9
81
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224
30
26
15
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1.96
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22
1.9
22
90
0
66
54
0
0
45
0.99
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42
2.5
42
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9
124
36
12
21
29
1.90
76288085--76288204
6
19.3
6
71
19
86
50
15
15
19
1.79
76288085--76288204
19
6.4
18
72
17
86
50
15
15
19
1.79
76288094--76288204
31
3.5
31
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1
150
50
14
16
18
1.78
76288341--76288420
27
3.0
26
87
3
106
33
21
23
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76288377--76288442
27
2.4
27
82
5
71
39
24
21
15
1.91
76288610--76288665
22
2.5
22
77
11
69
35
21
23
19
1.96
76289118--76289420
27
11.2
27
87
2
335
26
19
19
34
1.95
76289109--76289412
81
3.8
80
85
4
421
25
20
19
34
1.96
76289405--76289853
108
4.2
108
92
0
673
32
8
19
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1.83
76289405--76289853
27
16.6
27
84
0
565
32
8
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1.83
76291806--76291925
6
19.3
6
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19
68
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1.80
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1.79
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3.8
26
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37
20
23
18
1.94
76292324--76292387
22
2.9
22
77
9
67
35
23
21
18
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356