Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  26  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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330
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22
19
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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22
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4
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2.4
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0
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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28
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4
47
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9107883--9108025
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0
1
53
1.11
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19
2.8
19
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2
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18
1
5
74
1.11
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5
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19
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0
0
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0
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1.71
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0
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0
12
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1.37
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50
84
6
281
26
23
28
20
1.99
9113544--9113793
100
2.4
103
87
6
355
26
23
28
21
1.99
9116229--9116256
13
2.2
13
100
0
56
21
7
25
46
1.76
9118219--9118283
5
13.2
5
77
19
66
41
0
0
58
0.98
9118292--9118387
40
2.3
40
89
3
147
63
8
28
0
1.23
9119093--9119149
30
1.9
30
89
3
89
40
3
24
31
1.72
9119361--9119392
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
9119487--9119728
50
4.7
50
83
4
270
27
24
28
19
1.99
9119487--9119736
100
2.4
104
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26
24
28
20
1.99
9121767--9121799
5
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5
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0
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0
0
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35
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27
1.94
9128691--9128722
5
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7
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0
0
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14
2.2
14
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0
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0
80
0.71
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27
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10
10
36
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9136977--9137023
18
2.7
17
81
12
51
65
0
6
27
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
16
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0
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50
14
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17
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21
2.0
21
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0
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29
21
29
19
1.98
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16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
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39
2.0
39
94
0
138
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15
3
44
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21
2.8
20
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3
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0
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26
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0
0
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1
0
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10
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0
0
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20
2.3
20
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35
2
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1.31
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1.9
19
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2
0
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2
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17
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2
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1.20
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45
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17
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10
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8
20
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26
3.2
26
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17
20
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32
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25
3.2
25
63
16
65
16
25
27
31
1.96
9168289--9168573
50
5.5
51
88
3
335
19
28
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9168329--9168409
25
3.2
25
63
16
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18
27
27
27
1.98
9168676--9168707
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2.5
13
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0
55
56
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0
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1.37
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30
2.0
29
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3
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33
18
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1.66
9175939--9176020
26
3.2
26
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17
20
29
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1.95
9175954--9176033
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3.2
25
63
16
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16
25
27
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50
5.5
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335
19
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27
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13
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0
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2.2
18
90
0
60
35
17
20
25
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356