Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   

This is table  329  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105987730--105987899
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57
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4
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0
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21
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28
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2.1
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2.5
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0
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1.24
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112
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4
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1.41
105995240--105995301
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0
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1.44
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2.9
246
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0
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16
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2.1
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0
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1.42
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2.0
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0
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2.3
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17
82
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36
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27
2.0
26
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14
70
52
5
5
35
1.50
106016639--106016767
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4.7
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13
113
55
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6
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1.45
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14
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51
64
1
1
32
1.11
106016753--106016819
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2.6
24
80
15
73
64
1
1
32
1.12
106016710--106016856
62
2.3
63
78
10
140
59
4
3
31
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106016719--106016829
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2.9
37
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5
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2
3
34
1.29
106017028--106017102
3
23.7
3
75
5
51
54
4
8
33
1.48
106016983--106017102
6
19.8
6
69
16
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3
7
30
1.41
106016983--106017102
9
13.2
9
68
17
52
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7
30
1.41
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2.0
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0
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20
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0
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0
0
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0
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1.18
106039339--106039389
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2.2
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13
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11
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21
2.2
21
96
0
83
0
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23
30
1.53
106046648--106046699
21
2.5
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90
0
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1
44
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30
1.64
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2.2
24
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0
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3
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1.9
210
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21
14
32
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40
2.1
40
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33
19
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24
1.97
106071210--106071292
40
2.1
40
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4
132
33
18
22
25
1.96
106081726--106082270
210
2.6
207
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6
671
32
18
14
34
1.91
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7
3.6
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0
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28
28
1.97
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210
1.9
210
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1
580
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20
14
32
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0
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30
2
47
19
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2.5
22
88
2
76
30
3
45
20
1.68
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19
2.5
19
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50
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4
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0
0
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0.97
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17
2.9
17
88
8
68
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1
1
39
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106093432--106093489
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12
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1
1
37
1.18
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2.1
19
100
0
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5
15
42
1.68
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19
2.2
19
100
0
82
58
0
4
36
1.20
106101619--106101670
25
2.1
25
82
7
61
25
0
7
67
1.17
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2.1
19
100
0
80
57
5
0
37
1.21
106104465--106104629
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1.9
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83
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217
37
15
8
38
1.78
106105010--106105080
20
3.9
17
75
18
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32
2
0
64
1.08
106105016--106105080
9
6.9
10
75
16
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35
3
0
61
1.12
106104991--106105080
18
4.8
19
72
11
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33
3
1
62
1.19
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2
0
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1.06
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54
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6
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10
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1.80
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107
40
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10
28
1.86
106136510--106136569
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2.1
29
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30
10
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1.64
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15
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17
6
35
1.75
106138789--106138886
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2.7
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12
150
35
16
10
37
1.82
106138796--106138886
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15
10
37
1.83
106139237--106139465
45
5.1
45
76
8
223
25
28
15
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106139405--106139620
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2.8
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2
317
25
23
19
32
1.97
106139563--106140811
221
5.6
220
76
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1094
26
21
18
32
1.97
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3.4
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91
0
417
24
23
19
32
1.97
106139405--106140735
674
2.0
675
92
0
2232
26
22
18
32
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22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
106148864--106148942
35
2.2
37
86
13
121
35
16
10
37
1.82
106148885--106148940
17
3.5
15
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9
60
35
16
10
37
1.83
106148871--106148942
19
3.9
19
89
10
123
36
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37
1.83
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0
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0
0.82
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53
2.3
53
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0
190
17
18
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18
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18
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0
93
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14
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18
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0
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0
164
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21
32
1.91
106171170--106171255
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10
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5
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1.75
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106171174--106171266
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2.0
47
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1.02
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0
0
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0
0
73
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2.0
39
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2
111
19
0
29
50
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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4.2
41
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20
20
23
35
1.96
106176154--106176325
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2.1
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81
3
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20
20
23
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2.0
49
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0
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0
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0
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0.80
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2.0
118
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2.1
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2
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1.84
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20
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1.97
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22
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1.99
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1.57
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24
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22
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4
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1.74
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1.28
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19.4
14
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63
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0
7
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1.30
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0
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9
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0
202
45
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0
28
1.54
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2.1
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34
0
10
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20
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0
1.52
106224648--106224717
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2.3
31
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0
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17
8
18
55
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106233994--106234041
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18
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2.0
19
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0
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2.0
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0
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16
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2.0
27
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0
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37
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0
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50
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0
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4.4
24
73
23
73
30
8
5
55
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356