Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  91  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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23
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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35
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0
100
40
8
8
44
1.63
28823030--28823087
26
2.2
26
93
0
98
39
6
6
46
1.57
28823038--28823095
26
2.2
26
87
0
80
37
6
12
43
1.69
28823056--28823148
39
2.4
38
82
8
116
33
3
12
50
1.57
28829008--28829088
39
2.0
40
97
2
155
32
9
7
50
1.63
28829610--28830883
152
8.5
151
91
2
1922
28
6
7
57
1.50
28830057--28830101
22
2.0
22
82
0
54
31
2
4
62
1.27
28829610--28830883
607
2.1
605
91
3
2054
28
6
7
57
1.50
28830395--28830431
13
2.8
13
87
0
56
21
2
0
75
0.92
28830849--28830883
13
2.8
13
86
4
54
22
0
2
74
0.95
28830919--28831002
16
5.1
15
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12
60
22
3
2
71
1.13
28831313--28831346
10
3.4
10
88
12
52
0
23
0
76
0.79
28837390--28837479
23
3.7
24
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14
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18
21
27
1.97
28840401--28840439
20
2.0
20
90
10
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30
5
15
48
1.66
28842091--28842463
183
2.0
185
82
3
457
39
14
26
19
1.90
28846661--28846717
12
4.5
13
74
17
50
78
0
1
19
0.83
28846655--28846714
7
8.1
7
82
17
77
81
0
1
16
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28846706--28846739
14
2.4
14
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5
50
67
0
2
29
1.05
28847854--28848061
91
2.3
91
81
1
231
36
16
20
26
1.94
28854907--28854949
16
2.6
17
85
3
61
37
0
2
60
1.10
28856285--28856347
31
2.0
31
87
0
90
25
23
15
34
1.95
28856541--28856637
48
2.0
49
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9
137
27
22
20
28
1.99
28856541--28856637
25
4.0
24
86
9
135
27
22
20
28
1.99
28856686--28856732
20
2.3
20
96
0
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21
10
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1.88
28859604--28859653
20
2.6
19
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0
22
36
1.54
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2.6
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2
194
30
21
25
22
1.99
28860263--28860577
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49
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7
179
27
20
26
25
1.99
28860266--28860529
142
1.9
139
82
7
327
27
20
26
25
1.99
28864231--28864447
40
5.5
40
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3
262
24
21
28
25
1.99
28872305--28872521
40
5.5
40
88
3
280
24
22
28
24
1.99
28872301--28872521
119
1.9
119
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7
297
25
21
27
24
1.99
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2.0
40
97
0
153
28
4
12
54
1.58
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40
4.7
40
88
5
272
24
27
22
25
1.99
28892848--28893033
79
2.4
79
88
4
270
24
27
22
25
1.99
28900821--28900985
40
4.2
41
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11
186
24
27
22
24
2.00
28900837--28900985
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1.9
80
84
5
205
24
28
22
24
1.99
28908819--28909035
40
5.5
40
85
8
275
24
28
23
24
2.00
28915316--28915540
40
5.7
40
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8
246
25
28
21
24
1.99
28915318--28915540
119
1.9
120
83
6
292
25
27
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28923228--28923450
119
1.9
120
83
6
292
25
27
21
24
1.99
28923226--28923450
40
5.7
40
85
6
278
25
28
21
24
1.99
28926092--28926257
46
3.6
46
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5
165
22
27
18
30
1.98
28932611--28932655
22
2.0
22
100
0
90
17
13
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1.58
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27
14.9
27
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0
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1.81
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27
21.7
27
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281
34
22
7
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1.81
28940671--28940888
27
8.0
27
89
0
292
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3.8
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0
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26
2.00
28941092--28941199
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4.4
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100
28
22
23
25
1.99
28946209--28946302
6
15.3
6
71
16
59
46
14
19
19
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356