Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  260  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85401278--85401483
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2.0
94
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21
14
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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T
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26
24
2.00
85483186--85483370
80
2.3
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239
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1.94
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43
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0
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2.0
98
98
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1.9
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12
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1.21
85524945--85525001
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4.1
14
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57
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17
1
71
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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6
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73
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50
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4
2
83
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20
29
18
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85561273--85561369
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28
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21
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78
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85565242--85565305
16
4.2
14
77
16
65
1
17
3
78
0.96
85565246--85565294
26
1.9
25
84
12
64
2
16
2
79
0.92
85565242--85565309
21
3.2
21
78
15
70
1
17
2
77
0.96
85567833--85567929
30
3.2
30
73
2
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28
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27
29
1.94
85569482--85569532
15
3.5
15
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12
52
7
15
15
60
1.56
85569474--85569531
30
2.0
29
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10
82
10
15
15
58
1.62
85572801--85572863
11
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10
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3
4
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1.12
85574114--85574205
30
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1.97
85574523--85574567
17
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15
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24
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1.29
85577840--85577895
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2.7
21
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8
17
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1.21
85577839--85577895
14
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14
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1.19
85577857--85577994
18
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85577857--85577964
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26
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85579052--85579103
14
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14
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17
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73
1.19
85579041--85579112
13
5.5
13
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15
6
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1.20
85580596--85580639
20
2.2
20
83
0
52
40
15
18
25
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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0
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15
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27
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13
1.9
13
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0
50
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16
1.90
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18
1.9
18
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8
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2
52
1.47
85590793--85590843
14
3.6
14
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5
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13
7
1
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0
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1.90
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0
0
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1.72
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2.2
33
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25
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48
1.77
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26
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2.4
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0
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20
29
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1.97
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3.2
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58
7
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11
1.57
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2.3
42
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1
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1.58
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18
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2
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7
1.30
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23
2.4
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24
1
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20
3.3
19
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38
15
21
24
1.92
85637371--85637435
10
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10
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38
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24
1.92
85638468--85638555
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2.9
30
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0
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28
15
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13
2.2
13
100
0
56
39
17
28
14
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85642484--85642527
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3.7
12
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11
25
0
63
1.27
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12
4.1
12
81
0
53
16
24
0
59
1.37
85642479--85642527
24
2.0
24
84
7
64
16
24
0
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1.37
85642625--85642666
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0
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177
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13
100
0
50
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0
8
20
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356