Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  295  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95955319--95955396
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2.2
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81
2
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25
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28
29
1.96
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27
6.6
26
79
6
160
25
16
28
28
1.97
95985035--95985215
82
2.2
81
81
2
211
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2.0
20
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20
30
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
Entropy
(0-2)
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2
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20
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96026701--96026819
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5.1
23
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184
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20
21
31
1.98
96026700--96026819
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2.5
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190
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20
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1.97
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28
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83
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16
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22
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1.97
96123839--96123937
45
2.2
45
82
10
123
25
22
19
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1.97
96123862--96123946
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17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
25
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23
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27
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1.94
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93
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301
20
20
29
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96196885--96197013
46
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20
29
30
1.97
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18
2
60
1.47
96223295--96223358
15
4.3
15
74
16
62
12
14
12
60
1.58
96226167--96226233
20
3.3
20
91
0
116
35
13
19
31
1.90
96226283--96226461
24
7.4
24
94
1
313
30
20
20
27
1.98
96226283--96226461
73
2.5
72
95
1
313
30
20
20
27
1.98
96252468--96252507
21
2.0
21
90
5
64
50
25
0
25
1.50
96253122--96253162
21
2.0
21
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0
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2
9
43
1.50
96253166--96253205
21
1.9
21
85
10
55
35
5
25
35
1.78
96257861--96257898
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19
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1.91
96267754--96268099
40
8.7
40
95
0
615
30
20
26
22
1.98
96267754--96268099
159
2.2
159
96
1
631
30
20
26
22
1.98
96276439--96276791
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40
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0
589
29
20
27
22
1.98
96278345--96278378
15
2.3
15
89
0
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2
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50
1.54
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4.8
47
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3
332
31
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26
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42
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42
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1
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23
20
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1.98
96302050--96302411
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46
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290
23
19
27
29
1.98
96302098--96302357
47
5.6
47
72
15
216
25
18
26
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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93
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0
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27
29
1.98
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39
3.5
39
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0
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1.73
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2.2
26
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43
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17
1.86
96309577--96309653
24
3.2
24
74
3
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1.92
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26
25
1.98
96312926--96313333
201
2.0
201
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0
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20
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1.98
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2.1
23
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1.30
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24
8
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65
1.30
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27
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1.96
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1.9
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28
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1.96
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2.1
13
100
0
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1.88
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0
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4
0
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29
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29
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20
1.9
18
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10
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35
21
0
43
1.53
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3.0
45
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28
20
25
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43
4.7
43
91
1
280
35
20
13
30
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96376663--96376699
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1.9
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10
56
35
21
0
43
1.53
96379185--96379634
47
9.4
47
90
1
630
32
8
29
29
1.87
96379753--96379831
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2.1
37
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0
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24
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1.97
96381686--96381874
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4.4
43
97
0
360
21
14
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1.93
96381856--96381929
29
2.6
29
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4
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25
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96382240--96382515
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40
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279
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24
2.00
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0
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0
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0
0
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4.1
42
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9
167
22
15
17
45
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356