Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  317  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102672261--102672317
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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2.0
26
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0
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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59
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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32
1.29
102782449--102782517
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56
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2
40
1.11
102791074--102791792
356
2.0
356
98
0
1393
32
17
14
35
1.90
102796027--102796175
75
2.0
75
85
7
205
36
9
20
33
1.85
102800086--102800160
37
2.0
37
89
5
116
52
10
13
24
1.72
102803772--102803809
20
1.9
20
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10
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34
2
5
57
1.35
102806495--102806534
21
1.9
21
84
0
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32
1.56
102808516--102808545
15
1.9
16
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53
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43
1.78
102814788--102814820
17
2.0
17
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33
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3
48
1.60
102815106--102815330
46
4.9
47
87
2
271
20
23
13
41
1.88
102820225--102820279
23
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23
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41
0
0
58
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102820236--102820288
19
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19
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47
0
0
52
1.00
102820651--102820694
19
2.2
21
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8
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2
2
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1.27
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2
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100
0
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1.00
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15
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0
3
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1.17
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0
15
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102838896--102838940
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4.7
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79
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0
26
0.98
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2.3
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66
2
0
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1.03
102838888--102838933
11
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2
0
28
1.00
102843352--102843398
18
2.6
18
79
0
58
42
17
10
29
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
2.5
19
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10
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78
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2
10
1.04
102850121--102850307
3
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12
112
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5
28
1.34
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3
25
1.24
102866296--102866403
31
3.5
31
73
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102866286--102866407
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2.0
61
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0
208
35
2
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53
1.46
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2.2
18
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0
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1.23
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0
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102872987--102873242
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21
1.88
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137
2.0
137
78
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287
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13
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21
1.88
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2.0
17
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32
1.20
102874364--102874448
9
9.7
9
69
19
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62
1
3
32
1.20
102874457--102874535
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0
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2.8
28
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1
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1.25
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19
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1.29
102876842--102876886
19
2.4
19
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56
60
2
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31
1.35
102877138--102877187
15
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28
1.28
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4.7
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26
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20
29
1.99
102878687--102878891
43
4.7
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25
23
21
29
1.99
102878543--102878850
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14
131
26
22
21
29
1.99
102891738--102891763
6
4.3
6
100
0
52
30
0
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102897858--102897990
70
1.9
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83
4
167
44
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10
33
1.76
102898069--102898136
34
2.0
34
100
0
136
35
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8
38
1.81
102901000--102901104
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2.4
43
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167
32
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21
29
1.95
102906731--102906791
24
2.5
24
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0
104
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102906731--102906799
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0
0
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102915540--102915572
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0
0
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1.9
18
94
5
63
16
0
0
83
0.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356