Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  163  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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5
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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5
34
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
172
39
13
11
34
1.82
53009806--53009834
14
2.1
14
100
0
58
41
24
6
27
1.80
53009808--53009843
14
2.6
14
90
0
54
47
19
2
30
1.64
53028299--53028368
18
4.2
17
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20
58
31
1
12
54
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53032955--53033051
40
2.4
40
85
0
122
27
15
20
36
1.93
53032988--53033136
36
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37
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24
14
27
34
1.94
53054119--53054268
73
2.1
73
89
0
228
20
15
30
34
1.93
53057139--53057279
39
3.6
39
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0
237
28
29
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19
1.98
53061617--53061840
79
2.8
80
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7
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25
21
27
25
2.00
53061617--53061840
40
5.7
40
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6
289
25
21
27
25
2.00
53061617--53061873
79
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8
244
26
21
27
24
1.99
53069667--53069850
40
4.6
41
81
12
199
26
22
26
25
2.00
53069667--53069850
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2.3
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81
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26
22
26
25
2.00
53069719--53069873
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2.0
79
81
10
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27
21
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1.99
53079108--53079146
10
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10
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7
15
0
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43
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5
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28
20
23
29
1.98
53080632--53080749
43
2.8
41
80
6
121
27
20
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.3
14
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76
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0
19
0.95
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15
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15
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15
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0
1
26
0.96
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17
3.4
17
68
18
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70
3
3
22
1.18
53094188--53094260
34
2.1
34
100
0
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5
2
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1.16
53094205--53094265
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17
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1.09
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25
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0
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15
29
1.96
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48
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18
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0
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0
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2.0
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15
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271
26
21
26
26
1.99
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120
2.2
120
82
7
296
27
20
25
26
1.99
53131896--53132154
40
6.5
40
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5
251
27
20
25
26
1.99
53139902--53140127
40
5.7
40
87
4
280
25
21
26
26
1.99
53145576--53145672
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2.0
49
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0
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14
2.0
14
100
0
56
35
7
7
50
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53150474--53150513
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2.1
19
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57
0
0
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48
4.7
47
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235
22
26
20
29
1.99
53162474--53162701
96
2.4
95
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300
22
27
21
29
1.99
53199472--53199510
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2.0
20
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0
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5
0
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0
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5
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2
0
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53207358--53207397
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2
0
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0.83
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23
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37
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20
21
1.94
53220858--53221195
174
1.9
177
83
6
445
47
9
12
30
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356