Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  267  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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100
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20
1.96
Indices
Period
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Indels
Score
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1.9
133
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2.0
121
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206
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16
29
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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14
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85
0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1
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58
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2
38
1.12
87853924--87853958
11
3.2
11
87
0
52
62
0
0
37
0.95
87856258--87856399
11
13.0
11
68
20
57
29
3
2
64
1.25
87856258--87856469
15
13.5
15
65
21
69
31
3
2
63
1.23
87856267--87856321
21
2.7
19
76
15
56
25
1
7
65
1.28
87856314--87856379
34
1.9
34
85
11
91
31
4
0
63
1.14
87856287--87856386
41
2.4
42
81
11
107
30
4
3
63
1.28
87856391--87856469
37
2.2
36
82
11
99
34
2
1
62
1.17
87856323--87856490
7
22.9
8
65
29
58
33
3
0
61
1.17
87856323--87856490
15
11.4
16
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26
58
33
3
0
61
1.17
87856576--87856637
23
2.7
22
77
7
61
30
4
0
64
1.14
87856616--87856652
14
2.5
15
91
4
58
35
5
0
59
1.20
87856607--87856671
34
1.9
33
87
3
94
35
4
0
60
1.18
87856619--87856652
15
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14
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35
5
0
58
1.22
87856621--87856709
33
2.6
32
77
10
79
34
6
1
57
1.33
87861995--87862062
29
2.3
29
85
5
93
27
30
13
27
1.94
87862171--87862242
29
2.5
30
84
13
105
29
29
13
27
1.95
87870339--87870410
29
2.5
30
82
17
98
27
30
13
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87880437--87880632
83
2.3
87
81
9
235
34
16
19
29
1.94
87880437--87880655
83
2.6
85
76
14
213
34
16
19
29
1.94
87880146--87880801
289
2.3
289
92
2
1079
32
17
20
29
1.96
87882569--87882630
21
2.8
21
78
7
61
29
1
4
64
1.23
87882582--87882694
41
2.8
40
79
11
122
29
4
2
63
1.27
87882573--87882725
22
8.1
19
69
22
83
30
3
1
64
1.23
87882678--87882766
13
7.4
12
66
22
53
32
3
1
62
1.19
87882636--87882800
56
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58
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155
32
4
0
62
1.19
87882712--87882778
20
3.2
22
72
21
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2
1
59
1.22
87882700--87882797
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2.9
34
80
13
112
34
3
1
61
1.18
87882575--87882795
15
14.4
16
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25
72
32
4
1
61
1.25
87882893--87882925
11
2.7
13
81
18
52
24
12
0
63
1.28
87882918--87882958
14
2.8
15
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7
66
36
4
0
58
1.20
87883529--87883570
22
1.9
22
95
0
75
33
9
7
50
1.62
87883525--87883580
22
2.5
23
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11
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33
10
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48
1.65
87885884--87885942
14
3.8
16
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1
1
30
1.12
87885884--87885940
9
7.1
8
73
26
50
64
1
1
31
1.13
87888940--87889047
26
4.2
26
90
0
171
36
25
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32
1.81
87889449--87889509
30
2.0
30
87
0
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60
6
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24
1.49
87890720--87891101
44
8.7
44
86
0
539
27
28
13
30
1.94
87890720--87891097
177
2.1
176
88
0
549
27
27
13
30
1.94
87891177--87891259
43
1.9
43
82
2
103
26
25
15
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87891088--87891511
220
1.9
220
88
0
632
27
23
17
31
1.97
87903531--87903611
16
5.0
16
72
24
55
62
3
2
30
1.25
87903531--87903587
9
7.1
8
73
26
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64
1
1
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1.13
87904006--87904064
30
2.0
30
86
0
82
57
6
11
23
1.58
87905690--87905727
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2.1
19
90
5
60
81
13
5
0
0.85
87905895--87905925
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2.1
15
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0
53
54
9
12
22
1.67
87907761--87907796
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2.0
18
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0
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1.12
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2.1
215
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604
32
17
22
27
1.97
87926067--87926167
44
2.3
44
91
0
157
28
12
30
27
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356