Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  15  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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186
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62
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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38
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
89
32
10
10
46
1.71
5466937--5466980
19
2.4
18
84
3
52
34
6
0
59
1.24
5467001--5467046
24
1.9
24
86
0
65
32
10
4
52
1.56
5473956--5473980
8
3.1
8
100
0
50
0
36
12
52
1.39
5475884--5475979
48
2.0
48
100
0
192
29
12
22
35
1.91
5489629--5489670
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
5489804--5489913
45
2.6
44
80
8
113
33
28
4
33
1.78
5489894--5489947
16
3.4
16
81
0
72
33
33
0
33
1.58
5503761--5503809
26
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26
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4
64
77
2
10
10
1.07
5503774--5503815
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13
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78
0
11
9
0.96
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28
3
1
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1.17
5507518--5507570
24
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25
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9
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30
3
0
66
1.10
5515115--5515139
13
1.9
13
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0
50
8
0
28
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1.22
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1.9
42
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0
135
59
8
28
3
1.44
5521824--5521856
4
8.2
4
93
0
57
72
0
27
0
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5531597--5531639
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2.2
20
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4
61
46
4
0
48
1.22
5532124--5532199
30
2.6
29
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6
98
53
0
0
46
1.00
5534349--5534379
14
2.2
14
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0
53
38
3
0
58
1.15
5535425--5535500
38
2.0
38
87
5
109
32
13
11
42
1.80
5539998--5540153
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3.0
53
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4
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25
16
28
30
1.96
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45
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45
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14
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22
23
24
1.99
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135
3.6
135
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2
727
30
21
22
25
1.99
5562412--5562454
22
2.0
22
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0
2
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1.08
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2.0
25
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50
3
0
45
1.20
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16
2.7
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10
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20
0
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1.52
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2.1
28
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0
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10
17
36
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2.1
33
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0
129
15
17
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19
1.9
19
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8
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0
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0.98
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29
2.1
28
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12
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46
5
15
32
1.68
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2.0
87
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0
338
16
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16
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1.91
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14
2.1
14
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0
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33
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20
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1.97
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15
2.0
15
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0
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0
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1.47
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5
138
31
28
12
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1.92
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3.9
7
100
0
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0
0
14
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2.0
27
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0
101
25
9
36
29
1.87
5618319--5618348
7
4.3
7
95
0
51
36
0
16
46
1.47
5625306--5625487
67
2.9
59
82
13
215
36
8
16
39
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5645779--5645836
30
1.9
30
96
0
107
32
20
12
34
1.90
5655603--5655659
15
3.9
15
90
2
89
36
0
12
50
1.40
5656032--5656118
21
4.0
23
77
11
83
16
21
24
37
1.93
5656044--5656093
21
2.3
22
93
6
84
12
26
28
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1.92
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11
2.8
11
95
0
53
51
19
6
22
1.69
5679201--5679287
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4.0
23
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10
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14
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1.92
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2.0
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1
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2.0
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2
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1.07
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5
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41
0
0
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0.98
5687634--5687678
17
2.5
18
85
10
65
46
4
0
48
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356