Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  30  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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2.0
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2.0
21
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19
29
21
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10386912--10387132
74
3.1
73
70
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19
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11
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138
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46
5.6
46
87
0
347
20
24
13
41
1.89
10393253--10393308
11
4.9
11
82
8
67
62
3
0
33
1.12
10396234--10396400
46
3.6
46
85
3
219
19
23
14
41
1.89
10398133--10398191
24
2.6
22
83
5
82
62
1
0
35
1.05
10398133--10398188
11
4.9
11
85
8
76
62
1
0
35
1.06
10406930--10406980
24
2.1
25
85
3
68
37
7
15
39
1.77
10412763--10412914
43
3.5
42
79
10
157
32
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17
25
1.97
10412744--10412901
42
3.7
42
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160
30
25
18
24
1.98
10416734--10416785
17
3.0
17
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10
52
55
11
3
28
1.53
10418678--10418728
20
2.5
20
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9
59
50
0
5
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1.26
10425593--10425648
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20
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2
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12
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8
62
1.53
10430563--10430589
6
4.5
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0
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18
29
1.95
10433034--10433070
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2.1
18
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10438930--10438977
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20
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10438972--10439033
27
2.3
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0
37
1.38
10453438--10453472
13
2.6
13
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4
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17
0
8
74
1.06
10453427--10453472
14
3.2
15
82
14
53
21
0
8
69
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10453624--10453698
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37
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0
150
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5
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28
1.79
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23
2.1
23
100
0
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20
0
31
47
1.50
10455677--10455746
29
2.4
29
82
2
77
30
8
1
60
1.35
10455703--10455785
28
2.9
28
76
5
78
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8
2
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2.0
26
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33
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10457393--10457490
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3
35
1.19
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2.9
13
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0
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0
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1.14
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0
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13
29
1.95
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2.5
204
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2.0
26
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28
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10470664--10470761
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11
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2
2
34
1.19
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3.0
45
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9
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2.3
29
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26
1.31
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6
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4
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0
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0
0.86
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28
2.3
28
82
14
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1
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10486810--10486894
43
2.0
43
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0
152
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15
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50
1.76
10504624--10504666
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2.2
20
86
0
59
65
2
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27
1.25
10506932--10507039
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10507904--10507937
9
3.9
9
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52
2
17
0
79
0.86
10507904--10507937
17
2.0
17
94
0
59
2
17
0
79
0.86
10507946--10508018
5
14.6
5
76
20
64
56
4
0
39
1.19
10507947--10507989
19
2.3
19
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58
0
0
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0.98
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24
2.6
25
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9
71
58
4
0
36
1.19
10511447--10511498
15
2.9
19
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50
11
0
38
1.39
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0
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0
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64
0
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1.19
10515368--10515885
3
172.3
3
67
12
145
61
2
7
28
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356