Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  265  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87024994--87025042
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2.0
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2.5
155
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2.0
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0
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20.7
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1.97
87039700--87040254
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6.9
81
88
1
785
34
20
21
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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87040483--87040588
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3.9
28
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20
20
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22
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19
24
1.96
87042911--87043179
111
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297
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21
19
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1.96
87042911--87043179
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19
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1.96
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19
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0
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0
0
50
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27
1.99
87101424--87101459
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3.0
12
87
0
54
41
5
27
25
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.79
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2.3
23
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1
0
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1.03
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2.3
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4
32
1.38
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9.0
25
72
13
129
55
4
5
34
1.43
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28
4.8
29
92
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214
21
3
49
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1.65
87103913--87104052
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208
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3
49
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1.65
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2.1
26
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1.87
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1.56
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0
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13
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87145456--87145504
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12
100
0
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0
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0.71
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21
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19
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64
0
14
4
82
0.82
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98
1.8
98
93
0
311
30
29
15
24
1.96
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20
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55
2
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15
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0
1
20
0.87
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18
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0
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0
2
21
0.91
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0
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22
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51
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24
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28
24
19
27
1.99
87195217--87195286
15
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14
80
13
70
62
17
11
8
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87195217--87195286
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2.4
30
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1.52
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10
280
28
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20
25
1.99
87198277--87198522
100
2.5
100
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0
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1.99
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38
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0
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0
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126
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20
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109
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2.4
126
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0
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20
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1.97
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2.0
99
98
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2.3
126
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1.95
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19
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14
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0
0
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0
0
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2
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0
1.01
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20
25
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1.96
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47
2.5
48
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8
116
21
22
27
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87263888--87264372
174
2.8
175
91
2
773
33
19
20
27
1.96
87263888--87264411
87
6.0
88
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18
391
33
19
20
27
1.96
87269621--87269857
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2.7
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259
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4.3
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13
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76
0
5
17
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0
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26
1.9
26
83
4
64
26
20
18
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356