Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  23  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
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2.3
22
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2.0
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5
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8060115--8060182
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1
0
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Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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19
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15
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8119929--8119967
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19
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17
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1
2
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7
2
1.42
8131196--8131244
12
4.1
12
86
0
62
53
36
8
2
1.43
8140658--8140696
19
2.2
17
86
9
51
5
5
15
74
1.17
8142876--8142908
17
1.9
17
88
11
50
60
0
36
3
1.12
8144413--8144463
17
3.1
16
81
10
59
74
3
11
9
1.19
8145924--8145992
21
3.4
20
71
15
61
37
1
7
53
1.38
8145979--8146009
15
2.1
14
94
5
53
35
3
6
54
1.42
8146388--8146418
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
8150265--8150306
21
2.1
21
86
8
61
35
7
0
57
1.26
8151011--8151108
23
4.3
23
90
2
162
31
26
21
20
1.98
8151018--8151106
45
2.0
45
95
0
160
31
26
22
19
1.97
8151257--8151404
75
2.0
75
100
0
296
33
21
8
37
1.83
8160033--8160078
20
2.3
20
100
0
92
41
0
4
54
1.20
8160034--8160086
20
2.9
19
89
10
76
45
0
3
50
1.19
8161735--8161760
12
2.2
12
100
0
52
73
0
0
26
0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8161770--8161815
18
2.6
17
83
12
58
67
2
2
28
1.14
8161944--8162064
65
1.9
64
86
8
174
61
1
1
34
1.15
8162032--8162075
16
2.7
16
89
3
61
65
0
0
34
0.93
8175699--8176372
44
15.3
45
81
4
705
27
16
26
29
1.97
8175733--8176372
176
3.6
176
91
1
917
27
16
26
29
1.97
8179393--8179428
17
2.1
18
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5
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33
2
0
63
1.08
8180921--8180948
3
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3
100
0
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0
0
0.91
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16
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48
0
0
51
1.00
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1.9
18
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5
52
61
0
2
35
1.11
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19
1.9
19
88
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34
5
0
60
1.21
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19
2.7
19
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8
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54
0
0
45
0.99
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9
5.2
9
78
9
53
55
0
0
44
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1.9
28
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10
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52
0
0
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1.00
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10
3.4
10
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4
52
31
2
0
65
1.07
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12
4.8
12
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4
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26
1
5
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1.23
8218535--8218567
14
2.5
13
90
9
50
27
0
6
66
1.15
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18
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17
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25
0
0
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0.82
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25
2.8
26
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4
126
25
0
0
74
0.82
8220104--8220195
25
3.6
26
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5
80
34
0
0
65
0.93
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29
2.3
31
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7
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40
15
21
22
1.90
8222263--8222308
20
2.3
20
92
0
74
8
28
32
30
1.87
8238883--8239023
27
5.2
27
84
11
191
34
24
24
17
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8238883--8239023
54
2.6
54
93
2
239
34
24
24
17
1.96
8240645--8240752
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
8245794--8245858
26
2.4
27
84
2
78
44
24
1
29
1.63
8246768--8246821
22
2.5
22
74
14
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61
0
5
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49
4.9
49
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4
258
29
26
17
26
1.97
8249323--8249554
99
2.3
98
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3
259
30
26
17
25
1.97
8251281--8251316
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2.3
15
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9
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0
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2.3
15
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0
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2
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1.15
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0
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1.30
8259659--8259686
13
2.2
13
100
0
56
32
0
7
60
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356