Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  55  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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48
1.00
18084387--18084431
23
2.0
23
86
8
65
37
13
0
48
1.42
18089665--18089714
5
10.2
5
91
4
84
56
0
2
42
1.11
18090695--18091325
242
2.6
241
79
5
641
45
8
8
38
1.64
18101862--18102251
192
2.0
192
97
0
753
32
17
21
28
1.96
18102352--18102387
6
6.0
6
100
0
72
50
0
33
16
1.46
18104527--18104567
21
2.0
21
95
0
73
14
24
19
41
1.89
18106178--18106223
24
1.9
24
90
0
74
30
4
0
65
1.12
18108893--18108930
19
2.0
19
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0
58
60
5
2
31
1.33
18109429--18109495
32
2.1
32
100
0
134
38
5
14
40
1.71
18111646--18111700
3
18.3
3
100
0
110
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0
0
32
0.91
18115989--18116117
46
2.8
46
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0
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19
20
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30
1.97
18118242--18118377
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40
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34
25
16
23
1.95
18119173--18119207
17
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18
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11
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0
31
0
68
0.90
18119253--18119300
5
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5
100
0
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0
0
39
0.97
18120367--18120400
16
2.1
16
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10
52
23
0
2
73
0.97
18124549--18124587
21
1.9
20
84
5
51
17
17
5
58
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18126702--18126804
34
3.0
34
95
2
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27
3
33
35
1.75
18132539--18132577
13
3.1
13
81
3
53
66
0
0
33
0.92
18132609--18132647
21
1.9
20
89
5
60
48
2
10
38
1.51
18132960--18133003
18
2.4
19
80
3
54
31
0
4
63
1.14
18133032--18133066
14
2.6
14
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4
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42
0
0
57
0.99
18133240--18133333
48
2.0
48
100
0
188
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12
6
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1.69
18135758--18135897
27
5.2
28
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5
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23
17
1.95
18136000--18136075
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2.8
27
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100
30
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22
34
1.92
18136002--18136075
28
2.8
26
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10
22
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1.89
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3.2
26
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0
150
35
25
5
33
1.80
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22
1.9
22
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5
57
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4
9
39
1.58
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31
1.9
32
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6
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40
1
0
58
1.08
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18
2.5
18
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10
58
36
0
6
56
1.25
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46
7.9
46
93
0
579
38
15
23
23
1.92
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2.1
88
85
7
245
40
17
9
32
1.82
18143161--18143200
12
3.1
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45
0
0
55
0.99
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39
2.5
39
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20
101
49
1
1
48
1.15
18145536--18145630
7
14.1
7
72
16
58
49
1
1
48
1.15
18146804--18146860
22
2.6
22
83
8
80
14
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18151224--18151275
28
2.0
25
84
7
59
61
0
1
36
1.07
18151325--18151384
11
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11
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18
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1
1
28
1.09
18151552--18151674
19
6.3
19
67
20
67
39
1
3
55
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18151568--18151611
20
2.1
21
84
12
56
34
0
2
63
1.07
18151617--18151671
28
2.0
28
89
7
85
41
0
0
58
0.98
18151553--18151664
38
2.9
37
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10
100
38
1
3
56
1.27
18160515--18160578
12
5.3
12
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12
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53
3
0
43
1.16
18166437--18166664
48
4.8
48
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7
212
22
27
21
28
1.99
18174088--18174255
43
4.0
41
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151
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17
26
30
1.97
18174066--18174263
43
4.7
43
73
10
138
24
18
26
29
1.98
18174066--18174263
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2.3
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213
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18
26
29
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59
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0
229
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7
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36
1.79
18176836--18176901
25
2.7
25
78
2
71
25
18
21
34
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356