Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  315  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102151822--102152076
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1.9
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61
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1.35
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2.7
44
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14
23
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
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26
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102208676--102208733
26
2.2
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12
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3
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2.4
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0
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2.1
56
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221
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17
20
20
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
24
14
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3.8
38
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24
16
35
1.95
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2.5
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23
16
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1.94
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3.1
46
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22
17
37
1.94
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1.9
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1.41
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2.0
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2.5
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0
120
13
30
29
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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30
3
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2.3
51
92
0
185
29
23
14
32
1.94
102304729--102304883
51
3.0
51
90
0
238
29
21
15
32
1.94
102306632--102306656
11
2.3
11
100
0
50
16
0
0
84
0.63
102308601--102308653
23
2.3
23
83
6
63
45
5
1
47
1.37
102308640--102308670
14
2.2
14
94
0
53
45
0
0
54
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102308748--102308806
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2
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54
1
1
42
1.20
102309705--102309747
21
2.0
21
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59
62
2
0
34
1.08
102312891--102312921
15
2.1
15
93
0
53
35
0
3
61
1.12
102313041--102313116
20
4.0
20
71
15
61
28
0
3
67
1.09
102313039--102313118
29
2.8
27
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10
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27
0
3
68
1.06
102320693--102320762
22
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22
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11
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2
1
38
1.23
102320686--102320769
41
2.0
41
100
0
168
57
4
2
35
1.33
102320705--102320772
22
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22
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19
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2
2
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102326622--102326658
9
4.1
9
85
0
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10
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0
23
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102326742--102326800
18
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19
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5
0
32
1.17
102326741--102326803
19
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19
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61
4
0
33
1.17
102326815--102326857
21
2.0
21
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0
59
53
4
6
34
1.49
102327886--102327918
16
2.1
16
94
5
59
27
54
6
12
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102333388--102333426
19
2.1
19
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13
55
69
2
5
23
1.21
102333673--102333703
11
2.7
12
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41
0
0
58
0.98
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15
1.9
16
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6
53
53
3
0
43
1.17
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32
2.2
31
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10
84
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1.88
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2.0
45
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7
23
1.58
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6
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100
0
56
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0
0
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2.1
31
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21
9
13
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1.65
102360042--102360091
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3.2
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2.0
22
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0
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27
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2
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1.51
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15
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20
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1
0
65
1.00
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0
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7
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1.43
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44
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2.0
15
100
0
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20
2.0
20
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28
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54
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2
252
17
25
23
34
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27
5.9
27
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22
33
1.96
102394203--102394361
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2.0
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18
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22
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1.96
102397313--102397341
9
3.3
9
95
4
51
82
0
17
0
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102398454--102398502
18
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19
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48
0
28
22
1.50
102421872--102421955
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2.0
41
83
0
105
58
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17
1.60
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2.0
32
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0
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1.90
102427701--102427761
30
2.0
30
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25
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100
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0
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2
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2
0
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5.9
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94
0
843
25
20
20
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356