Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  54  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17648465--17648496
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0
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10
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17667574--17667643
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5
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10
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17677282--17677430
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1.99
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2.0
15
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13
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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108
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2.0
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21
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2.5
24
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2.1
118
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2
42
1.34
17740837--17741133
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156
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2
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3
5
47
1.41
17741093--17741227
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15
65
24
61
50
3
2
43
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
119
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5
3
40
1.45
17741312--17741350
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51
0
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1.24
17741317--17741350
17
2.0
17
94
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59
50
0
5
44
1.26
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2.1
92
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4
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17
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26
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1.9
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10
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36
13
6
43
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17798769--17798881
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22
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0
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0
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64
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1.28
17802819--17802876
27
2.1
27
81
12
66
46
10
1
41
1.48
17802848--17802877
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
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8
8.5
8
73
17
50
77
0
3
19
0.90
17804303--17804362
20
2.9
19
83
16
68
76
0
3
20
0.92
17804295--17804362
15
4.8
13
78
21
59
76
0
2
20
0.92
17809964--17810002
17
2.2
19
86
9
55
58
5
10
25
1.51
17810776--17810805
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
17812915--17812945
15
2.1
15
100
0
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25
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22
1.90
17817653--17817730
31
2.5
31
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0
102
37
14
8
39
1.77
17828335--17828380
15
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14
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11
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60
0
0
39
0.97
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19
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2
0
36
1.08
17828708--17828764
28
2.1
27
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28
7
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1.19
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48
19
1.64
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18
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0
150
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24
27
1.96
17838635--17838727
36
2.6
36
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0
168
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1.96
17839273--17839303
11
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0
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29
3
48
19
1.64
17843918--17843947
15
1.9
16
93
6
53
70
0
0
30
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
21
100
0
80
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20
25
1.96
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24
2.0
24
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0
89
26
26
10
36
1.88
17850724--17850768
20
2.2
20
88
0
63
46
4
11
37
1.60
17855335--17855434
44
2.3
44
98
0
191
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23
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1.93
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7
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7
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0
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0
29
25
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1.54
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0
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7
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22
1.70
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9
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12
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1.93
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13
28
1.94
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2.4
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279
30
27
13
28
1.94
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2.3
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5
264
30
27
14
27
1.95
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31
3.7
31
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0
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27
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26
1.99
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4.9
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10
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26
12
28
1.93
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4.8
49
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4
253
30
26
13
28
1.94
17869345--17869569
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2.5
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11
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12
28
1.93
17869677--17869786
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31
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2
150
26
26
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28
1.99
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2.4
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2
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25
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2.7
18
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3
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83
2
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6
0.87
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3.2
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6
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76
3
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1.13
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2.0
22
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4
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4.3
23
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10
40
1.84
17878349--17878786
146
3.0
147
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31
18
24
25
1.97
17878698--17878792
43
2.2
46
83
11
119
33
12
23
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17883125--17883166
19
2.2
19
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8
59
23
23
9
42
1.83
17887531--17887658
64
2.0
64
96
0
238
30
18
15
35
1.92
17887775--17888272
44
11.0
44
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29
20
22
27
1.98
17887728--17888054
140
2.3
140
91
0
528
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20
21
25
1.98
17887825--17888010
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1.9
96
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2
248
31
20
22
25
1.98
17890189--17890241
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20
90
3
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1.33
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7
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16
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1.9
26
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66
38
2
0
60
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18
1.9
17
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5
59
41
0
2
55
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356