Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  309  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100523260--100523304
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0
50
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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20
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3.5
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19
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
1.94
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1.92
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11
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21
21
28
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.94
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20
21
29
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1.98
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32
83
6
81
27
14
16
40
1.88
100679058--100679105
16
3.1
16
78
3
53
77
6
8
8
1.14
100685335--100685388
27
2.0
27
85
7
74
16
16
22
44
1.86
100699568--100700010
69
6.4
68
74
5
284
35
21
19
23
1.96
100699692--100700010
138
2.3
137
82
2
372
36
21
19
22
1.95
100700387--100700457
35
2.0
35
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10
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38
5
11
45
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100700448--100700498
14
3.8
14
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10
52
58
9
0
31
1.30
100700441--100700508
26
2.6
26
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2
82
55
10
1
32
1.42
100700764--100700817
26
2.1
25
83
10
65
51
11
5
31
1.60
100700839--100701033
69
2.8
68
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7
225
35
25
20
18
1.95
100701014--100701073
30
2.0
30
100
0
120
26
33
20
20
1.97
100701092--100701361
69
3.9
69
80
4
285
33
25
21
19
1.97
100700830--100701267
237
1.8
237
80
1
529
34
25
20
19
1.96
100701092--100701361
138
2.0
137
83
2
344
33
25
21
19
1.97
100701379--100701536
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2
210
29
24
20
25
1.99
100717622--100717659
17
2.2
18
90
4
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28
5
2
63
1.30
100728769--100728818
21
2.5
20
77
6
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36
0
6
58
1.23
100729684--100729821
71
1.9
71
98
0
267
30
9
5
55
1.54
100731616--100731668
18
3.1
17
81
10
63
62
7
0
30
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100734023--100734112
40
2.2
40
84
0
117
40
28
17
13
1.88
100737364--100737471
25
4.3
25
79
8
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33
19
28
18
1.96
100738246--100738292
23
2.0
23
95
0
85
44
19
4
31
1.70
100740056--100740093
15
2.4
17
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16
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0
0
15
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0.63
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2.5
12
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5
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0
0
13
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0.58
100740065--100740093
6
5.0
6
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51
0
0
13
86
0.58
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34
1.9
33
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9
83
32
1
0
66
1.02
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0
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0
0
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2.1
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2
0
60
1.09
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60
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0
322
32
3
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1.47
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2.0
13
100
0
52
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43
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2.0
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5
141
24
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2.3
18
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0
57
21
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45
1.77
100772746--100772929
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3.0
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62
2.1
61
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4
175
38
5
9
46
1.60
100775939--100776001
25
2.5
25
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0
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20
19
6
53
1.66
100775960--100776010
25
2.0
25
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77
19
21
3
54
1.60
100776108--100776747
126
5.1
126
86
1
806
27
17
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1.89
100776835--100776962
28
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28
78
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132
40
13
0
45
1.49
100776865--100776930
33
2.0
33
90
3
105
43
12
0
43
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100776835--100776963
62
2.1
61
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4
179
41
13
0
44
1.49
100776895--100776972
28
2.8
28
88
2
120
42
14
0
43
1.45
100777742--100777781
20
2.0
20
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0
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50
7
0
42
1.30
100779278--100779320
16
2.7
16
100
0
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25
27
1.97
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15
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23
36
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100784935--100785005
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3.4
21
88
0
106
18
28
23
29
1.98
100784911--100785019
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2.5
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22
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2.5
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20
19
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1.66
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2.0
25
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77
19
21
3
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1.60
100787843--100788481
126
5.1
126
85
3
790
27
17
14
39
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356