Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  193  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62977427--62977524
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1.9
108
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1.80
62978031--62978250
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4.1
54
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287
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20
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1.80
62978031--62978250
81
2.7
81
81
2
280
42
7
20
29
1.80
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20
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18
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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18
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2.0
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40
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.00
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2.3
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21
13
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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60
41
15
7
35
1.76
63135466--63135558
40
2.3
41
86
3
125
23
39
22
13
1.90
63136490--63136520
15
2.1
15
100
0
62
48
6
19
25
1.72
63160134--63160318
40
4.7
40
82
6
207
27
27
21
24
1.99
63160134--63160318
79
2.3
82
81
7
211
27
27
21
24
1.99
63168108--63168291
40
4.6
40
78
10
189
26
28
21
23
1.99
63168108--63168292
79
2.3
80
81
7
207
26
28
21
23
1.99
63172022--63172083
28
2.2
29
88
2
90
27
11
32
29
1.91
63174003--63174171
46
3.6
46
81
7
166
21
31
17
28
1.96
63191341--63191384
21
2.1
21
91
0
70
47
25
0
27
1.52
63192762--63192910
45
3.3
45
81
4
176
20
18
15
45
1.85
63195953--63196169
45
4.9
45
89
3
300
24
20
27
27
1.99
63198750--63198808
21
2.9
21
89
2
84
32
20
10
37
1.86
63198750--63198816
10
6.6
10
83
6
82
32
19
10
37
1.86
63206484--63206548
11
6.1
11
72
12
55
32
15
13
38
1.87
63206519--63206554
10
3.6
10
92
7
56
33
16
11
38
1.84
63206497--63206536
21
1.9
21
94
0
71
32
17
10
40
1.83
63213554--63213728
45
3.9
45
97
0
332
21
22
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63217951--63218051
27
3.8
27
85
1
132
34
22
23
18
1.96
63220938--63221163
26
9.1
26
65
18
106
39
21
20
19
1.93
63223160--63223319
74
2.1
75
86
2
214
51
8
10
29
1.66
63223295--63223572
138
2.1
135
85
4
373
39
8
5
47
1.56
63227780--63227817
19
2.0
19
100
0
76
36
15
26
21
1.93
63230886--63231124
41
5.8
41
87
6
290
27
25
20
27
1.99
63237921--63238159
41
5.8
41
87
6
290
27
25
20
27
1.99
63256013--63256063
20
2.7
19
75
19
61
52
3
1
41
1.31
63256755--63256802
24
2.0
24
100
0
96
37
8
20
33
1.83
63257700--63257731
15
2.1
15
94
0
55
68
9
6
15
1.36
63260615--63260653
17
2.3
17
90
0
60
48
20
5
25
1.70
63260622--63260656
17
2.1
17
100
0
70
48
17
11
22
1.79
63271328--63271386
6
9.8
6
94
0
82
28
0
49
22
1.50
63271439--63271594
76
2.1
76
100
0
312
35
22
16
25
1.95
63272125--63272180
27
2.1
27
100
0
112
46
10
0
42
1.38
63275081--63275157
31
2.5
30
75
8
82
31
16
7
44
1.77
63279262--63279300
19
2.0
20
95
5
71
17
0
10
71
1.12
63279262--63279326
19
2.9
23
84
13
66
24
0
9
66
1.21
63281946--63282008
12
5.4
12
71
22
55
47
0
3
49
1.17
63281946--63282008
22
2.7
23
77
20
69
47
0
3
49
1.17
63282067--63282117
26
2.0
26
88
3
77
50
7
0
41
1.31
63282190--63282282
44
2.1
46
84
8
120
35
23
5
35
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63283816--63283957
3
46.3
3
72
5
97
30
7
2
59
1.37
63283833--63283957
28
4.5
28
79
9
112
29
8
1
60
1.34
63284267--63284297
12
2.7
12
95
5
55
16
0
0
83
0.64
63288721--63288747
14
1.9
14
100
0
54
18
0
0
81
0.69
63289765--63289945
46
3.9
46
90
1
247
22
24
13
40
1.89
63303723--63304137
88
4.7
88
88
3
611
32
20
23
22
1.98
63303733--63304135
44
9.2
43
64
16
157
32
20
23
23
1.98
63305048--63305174
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3.0
42
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152
29
25
14
30
1.94
63305133--63305256
47
2.7
46
81
5
142
30
27
14
27
1.95
63305281--63305459
31
5.8
31
89
1
261
25
26
19
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356