Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  73  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23030007--23030053
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2.1
22
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0
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2.2
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1.57
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2.0
24
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43
4
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1.72
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38
2.3
38
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44
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20
1.82
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2.0
36
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5
90
50
26
5
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1.67
23032704--23032750
16
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1.40
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93
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9
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0
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22
22
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2.0
62
100
0
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21
18
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1.97
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31
2.2
32
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1
1
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1.15
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0
0
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1.9
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2.4
18
75
10
56
34
2
0
63
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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4
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2.9
18
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0
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15
26
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1.95
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20
2.3
20
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39
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1.63
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14
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14
100
0
54
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0
0
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10
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32
10
2
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1.45
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46
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20
23
13
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40
4.6
40
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287
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27
22
24
2.00
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2.0
28
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3
0
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1.15
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80
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2
2
33
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2.5
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81
10
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3
3
29
1.31
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5
10.6
5
81
10
60
24
17
0
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22
2.6
22
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71
24
17
0
57
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10
0
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3.0
12
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31
8
0
60
1.27
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30
2.9
28
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15
91
22
7
2
67
1.26
23161864--23161941
15
5.1
15
73
17
63
24
6
2
66
1.28
23162113--23162168
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14
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19
28
0
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1.47
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5
10.0
5
77
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20
27
0
51
1.47
23162112--23162168
22
2.6
22
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80
19
28
0
52
1.46
23162167--23162199
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2.1
16
88
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50
27
0
0
72
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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10
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2.1
27
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0
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1.35
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26
16
0
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1.44
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4.3
47
73
17
150
25
14
0
59
1.39
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89
2.5
89
80
11
207
25
14
0
59
1.41
23162350--23162523
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2.0
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219
25
13
1
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1.41
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7.1
55
81
4
428
32
18
16
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2.0
21
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23
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2.7
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28
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19
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1.99
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88
87
3
266
29
19
22
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23195664--23196330
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3.1
220
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78
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407
32
18
22
25
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45
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228
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12
28
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20
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0
0
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0.92
23198512--23198570
17
3.1
19
85
14
86
38
10
15
35
1.81
23204174--23204236
19
3.4
18
80
6
74
82
0
12
4
0.82
23205182--23206220
84
12.4
84
87
5
1509
30
23
21
24
1.99
23205182--23206220
166
6.2
170
92
2
1521
30
23
21
24
1.99
23206345--23206543
87
2.3
89
85
3
260
33
19
20
27
1.96
23206388--23206570
87
2.1
87
82
2
224
33
19
20
26
1.97
23209047--23209090
16
2.7
17
82
10
65
25
0
22
52
1.48
23209047--23209091
15
2.9
15
81
18
56
26
0
22
51
1.49
23209078--23209284
96
2.1
95
80
4
234
40
1
16
41
1.58
23209373--23209904
125
4.3
125
90
1
827
33
18
21
26
1.96
23212929--23213312
116
3.3
116
94
0
660
47
8
3
39
1.53
23213703--23213739
18
2.1
18
94
0
65
40
13
27
18
1.88
23215544--23215594
20
2.5
20
83
6
57
39
0
29
31
1.57
23215544--23215593
11
4.7
11
75
9
59
38
0
30
32
1.58
23215544--23215601
11
5.5
10
76
15
55
39
0
27
32
1.57
23215544--23215607
31
2.1
31
85
5
85
40
0
26
32
1.56
23216698--23216738
21
1.9
22
85
5
57
65
7
0
26
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23217954--23217998
20
2.3
20
88
3
65
62
6
4
26
1.39
23219851--23219902
24
2.2
24
96
0
95
42
15
21
21
1.89
23225197--23225237
7
5.9
7
94
0
73
53
0
17
29
1.44
23226049--23226083
17
2.0
18
88
5
54
65
2
0
31
1.07
23226049--23226083
18
2.0
17
88
5
52
65
2
0
31
1.07
23226530--23226571
15
2.7
16
81
3
59
35
0
2
61
1.09
23231728--23231895
38
4.2
38
75
13
158
30
23
14
31
1.94
23231735--23231935
85
2.4
85
90
1
314
29
23
14
31
1.95
23233870--23233958
25
3.6
25
89
3
135
24
26
19
29
1.98
23235992--23236035
16
2.7
16
86
10
54
61
4
0
34
1.16
23236333--23236387
24
2.3
24
90
3
85
18
14
23
43
1.87
23237792--23237846
21
2.7
20
81
10
58
47
0
5
47
1.25
23238047--23238080
17
2.1
17
88
5
52
70
0
0
29
0.87
23244034--23244071
18
2.0
20
90
10
62
36
0
0
63
0.95
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75
2.0
75
100
0
302
26
25
29
19
1.98
23255022--23255056
18
1.9
18
88
0
52
25
25
8
40
1.84
23257047--23257077
16
1.9
16
93
0
53
35
3
9
51
1.51
23262759--23262804
19
2.3
20
88
3
67
21
13
19
45
1.84
23264147--23264499
46
7.7
46
89
0
465
19
23
15
41
1.89
23268748--23268785
18
2.1
19
90
5
60
42
0
55
2
1.14
23268931--23268957
14
1.9
14
100
0
54
37
14
18
29
1.91
23271661--23271710
24
2.1
24
96
0
91
30
16
24
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23287449--23287476
14
2.0
14
100
0
56
35
28
7
28
1.84
23287908--23288411
247
2.0
246
95
1
911
33
21
12
32
1.91
23294062--23294118
29
2.0
29
86
6
80
47
10
10
31
1.72
23302719--23302752
17
2.1
16
88
5
50
38
2
0
58
1.13
23305596--23305638
11
4.5
10
81
18
56
18
2
18
60
1.47
23313319--23313448
47
2.8
47
82
9
158
24
16
26
31
1.97
23316040--23316100
31
2.0
31
93
0
104
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9
11
39
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2.0
23
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51
2
2
44
1.24
23319111--23319204
48
2.0
48
83
8
120
40
23
12
23
1.89
23321627--23321720
48
2.0
48
83
8
120
40
23
12
23
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356