Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  86  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27037732--27037829
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19
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36
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27037732--27037829
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135
38
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36
1.78
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1.99
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2
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26
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1.26
27064951--27065148
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26
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27
1.27
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2.6
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104
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17
26
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178
2.6
179
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18
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1.97
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11
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22
27
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4.0
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157
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22
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1.96
27073158--27073279
43
2.8
44
82
4
151
28
25
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
3
55
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20
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1.99
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20
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1.34
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2.8
25
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2.0
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60
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2.2
33
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1
1
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54
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38
1.35
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1.9
66
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4
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2.0
24
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0
69
37
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56
1.30
27109916--27109974
30
2.0
30
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2.2
19
83
12
50
19
21
2
57
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27124474--27124520
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20
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2.1
65
94
0
232
24
13
29
32
1.93
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10
6.1
10
79
9
70
68
1
6
23
1.22
27132287--27132346
20
3.1
19
85
7
84
68
1
6
23
1.22
27132984--27133174
96
2.0
98
88
2
287
32
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1.94
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2
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28
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1.24
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30
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32
12
25
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27177825--27177997
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13
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20
37
27
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1.92
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1.98
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49
77
13
175
30
19
28
21
1.97
27194845--27194975
55
2.4
55
81
5
140
22
23
29
24
1.99
27195503--27195543
3
13.7
3
100
0
82
65
0
0
34
0.93
27198261--27198321
19
3.1
19
81
9
70
47
1
0
50
1.10
27198551--27198614
13
4.9
13
71
7
58
35
26
6
31
1.81
27209217--27209468
126
2.0
126
100
0
504
50
18
14
17
1.79
27210331--27210375
16
2.8
17
87
9
60
64
0
6
28
1.19
27210961--27211011
19
2.8
18
74
11
50
27
3
3
64
1.28
27220252--27220347
44
2.2
44
90
0
156
23
11
28
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1.90
27223052--27223081
11
2.6
12
94
5
53
33
0
10
56
1.32
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25
2.1
25
100
0
104
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11
42
1.80
27226560--27226584
3
8.3
3
100
0
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32
1.58
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18
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0
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1.42
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21
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21
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4
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14
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15
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15
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42
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27233804--27233878
35
2.1
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4
127
38
8
12
41
1.72
27236868--27237052
40
4.6
40
80
6
221
23
27
24
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27236832--27237052
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2.8
81
82
11
237
24
26
23
25
2.00
27239084--27239163
42
1.9
42
84
5
108
22
33
25
18
1.97
27239718--27239756
16
2.3
18
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8
55
61
0
2
35
1.10
27245693--27245759
35
1.9
35
90
3
109
41
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10
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1.74
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5
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0
0
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0
0
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19
0
0
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0
0
15
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1
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54
0
0
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0.99
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2.0
157
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1.38
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52
2
0
45
1.13
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15
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52
0
0
47
1.00
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2.4
11
100
0
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1.61
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30
100
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50
4.9
50
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339
26
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24
1.97
27277967--27278256
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94
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330
25
18
31
24
1.97
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4
100
0
50
24
0
0
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14
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1.84
27282701--27282762
27
2.3
27
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5
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45
19
9
25
1.81
27282648--27282762
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2.1
54
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3
142
42
17
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27
3.8
27
74
13
77
20
15
20
43
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27283534--27283602
32
2.2
32
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10
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13
20
26
40
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27284704--27284733
15
2.0
15
93
0
51
70
13
10
6
1.34
27286308--27286368
32
1.9
32
96
0
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16
3.2
16
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53
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1
36
1.41
27286312--27286377
32
2.1
32
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2
89
57
6
1
34
1.33
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24
2.2
24
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1
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76
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2.0
69
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0
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19
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1.13
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17
1.9
18
88
5
52
41
0
23
35
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356