Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  40  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
0
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2.1
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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24
2.00
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26
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0
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4
1
67
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
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1
3
56
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0
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2.9
133
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3
534
33
19
19
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13320175--13320439
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1.99
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5
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0
1
53
1.10
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107
2.0
107
100
0
426
43
19
15
21
1.87
13356226--13356264
20
2.0
20
85
5
53
35
15
0
48
1.45
13361050--13361101
26
2.0
27
84
3
70
61
0
0
38
0.96
13361107--13361144
18
2.2
17
86
9
51
23
7
0
68
1.16
13362934--13362983
26
1.9
26
83
0
64
36
18
10
36
1.84
13362978--13363031
19
2.9
19
80
2
65
50
12
5
31
1.64
13362980--13363031
18
2.8
19
82
5
70
51
11
5
30
1.61
13364395--13364437
15
2.8
15
86
10
52
6
16
0
76
0.99
13364404--13364437
16
2.2
15
89
5
50
8
14
0
76
1.01
13373063--13373232
40
4.3
40
89
0
225
26
27
21
24
1.99
13373061--13373285
80
2.8
79
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3
218
26
27
20
24
1.99
13373217--13373294
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
13379982--13380127
39
3.7
40
84
9
176
28
27
19
23
1.99
13379982--13380127
79
1.8
79
86
5
215
28
27
19
23
1.99
13379982--13380203
40
5.6
39
80
6
198
27
27
20
24
1.99
13380000--13380203
79
2.6
79
81
3
212
26
27
20
25
1.99
13382318--13382457
39
3.6
39
91
0
217
13
22
23
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13383731--13383847
53
2.1
54
84
4
155
28
14
23
33
1.94
13383732--13383893
53
3.3
47
79
11
139
24
14
27
32
1.95
13385030--13385086
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
13385454--13385539
21
4.1
21
83
0
100
17
20
24
37
1.94
13388487--13388551
21
3.2
21
72
12
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13
24
21
40
1.90
13388469--13388569
39
2.6
39
93
0
166
13
24
23
37
1.92
13390187--13390227
19
2.0
21
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9
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24
19
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1.85
13391123--13391345
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1.8
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1
311
41
13
18
26
1.87
13392262--13392301
21
1.9
21
85
10
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62
2
0
35
1.09
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3.5
39
71
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25
16
26
30
1.97
13394680--13394705
11
2.4
11
100
0
52
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0
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5
7.8
5
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0
69
43
0
15
41
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15
2.1
15
100
0
62
25
32
19
22
1.97
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21
2.0
21
100
0
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46
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1.79
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11
2.8
12
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13
50
65
0
0
34
0.93
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20
2.0
20
100
0
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10
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17
2.1
16
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5
52
62
2
5
28
1.32
13412122--13412495
39
9.5
39
93
0
604
28
28
23
19
1.98
13415951--13415995
20
2.3
19
81
11
56
51
0
22
26
1.49
13419955--13419983
14
2.1
14
100
0
58
44
6
20
27
1.77
13419969--13420230
46
5.7
46
90
1
373
37
14
25
22
1.92
13421775--13421865
46
2.0
46
95
0
164
39
7
12
40
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13425477--13425522
21
2.2
21
88
0
65
26
6
23
43
1.78
13429167--13429243
35
2.4
31
74
19
84
29
18
10
41
1.83
13430526--13430600
32
2.3
32
86
6
98
26
17
24
32
1.97
13430539--13430601
32
2.0
32
93
0
108
25
14
26
33
1.94
13456158--13456192
18
2.1
17
89
10
54
45
0
17
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1.48
13465869--13466014
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2.7
53
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15
147
38
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18
17
1.92
13465881--13466010
27
4.8
26
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11
129
38
27
18
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1.9
31
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0
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4.3
6
100
0
52
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0
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0
0.62
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6
4.2
6
100
0
50
0
32
36
32
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356