Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  37  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.74
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.8
130
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21
30
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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10.0
11
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2
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206
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4
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39
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12387970--12388141
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1.8
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93
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21
1.99
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28
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21
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9
68
57
1
1
39
1.18
12391031--12391073
14
3.1
14
87
9
54
76
6
0
16
0.99
12391623--12391664
20
2.0
22
90
9
70
52
0
7
40
1.29
12391618--12391664
20
2.1
23
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18
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51
0
6
42
1.27
12391608--12391657
25
2.0
25
84
0
64
54
0
6
40
1.25
12392015--12392063
21
2.4
21
86
3
64
57
4
0
38
1.18
12392054--12392126
24
3.0
25
75
17
73
58
4
0
36
1.17
12392061--12392110
23
2.2
23
89
7
75
62
2
0
36
1.07
12392151--12392212
9
6.7
9
78
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70
80
1
1
16
0.87
12392151--12392212
19
3.3
18
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12
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80
1
1
16
0.87
12404301--12404351
26
2.0
26
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0
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17
19
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37
1.94
12404536--12404568
12
2.8
12
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33
0
0
66
0.92
12420977--12421462
44
11.0
44
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29
26
17
26
1.97
12420984--12421462
132
3.6
132
94
0
805
29
26
17
26
1.97
12442669--12442716
24
2.0
24
87
0
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2
29
1.37
12444196--12444229
16
2.1
16
88
0
50
52
5
2
38
1.41
12451122--12451171
18
2.9
17
82
11
66
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12451480--12451507
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3.1
9
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0
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10
0
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1.38
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19
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19
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3
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26
0
0
73
0.83
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10
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17
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0
0
72
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24
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4
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13
0
24
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0
0
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0
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0
1.53
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23
1
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1.32
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0
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38
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1.97
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22
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2.7
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109
22
1
34
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1.61
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15
3.6
15
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15
1
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42
1.58
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2.1
84
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0
270
34
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9
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48
19
0
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1.49
12495413--12495471
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21
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47
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0
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0
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1
0
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1.05
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3
100
0
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0
0
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2.5
10
100
0
50
20
20
8
52
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12513666--12513710
19
2.3
19
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48
11
11
28
1.73
12513924--12513964
20
2.1
19
86
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55
51
2
2
43
1.28
12514486--12514538
21
2.5
21
84
0
70
37
18
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2.6
26
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27
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58
1.50
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4
11.5
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2
16
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0.79
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2
15
0
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2.0
32
82
8
78
45
6
0
48
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356