Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  223  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73118028--73118203
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3.8
46
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1.8
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1.99
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46
3.8
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1.98
73123577--73123747
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1.8
93
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0
252
23
20
26
29
1.99
73125775--73125899
46
2.7
46
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0
178
21
20
27
30
1.98
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2.2
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19
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19
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0
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2.0
19
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0
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31
0
36
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.5
30
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20
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69
0
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1.27
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2.5
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20
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18
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2.4
24
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15
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2.4
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2.2
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28
4.4
28
91
2
176
26
12
27
34
1.92
73222393--73222503
28
4.0
27
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3
116
28
11
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1.91
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5.7
40
88
4
271
25
26
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
26
26
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4.7
40
85
7
218
26
21
26
26
1.99
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5.7
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26
22
25
2.00
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2.9
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15
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2.3
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1.8
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94
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28
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1.99
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28
28
21
21
1.98
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2.0
25
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3
93
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8
20
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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13
21
13
52
1.73
73318115--73318193
18
4.4
18
74
6
61
40
13
13
31
1.85
73321123--73321254
48
2.7
49
82
2
149
30
21
25
21
1.99
73321175--73321295
48
2.5
48
79
2
127
29
20
22
27
1.98
73324464--73324504
20
2.2
19
86
8
57
75
2
0
21
0.92
73324840--73324890
10
5.1
10
79
9
59
41
0
0
58
0.98
73324958--73324998
19
2.2
19
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4
57
26
4
0
68
1.10
73325006--73325070
15
4.0
16
78
13
62
29
0
3
67
1.05
73324994--73325041
8
5.6
8
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5
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31
2
0
66
1.03
73326167--73326247
41
2.0
40
85
9
110
46
2
0
50
1.14
73326568--73326630
31
2.0
31
96
0
117
41
6
12
39
1.69
73332033--73332188
68
2.2
68
77
13
149
20
28
16
34
1.94
73344473--73344555
40
2.1
40
88
0
121
40
8
18
32
1.80
73348421--73348523
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2.2
47
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15
24
1.93
73356538--73356718
40
4.5
39
78
7
159
24
25
24
25
2.00
73363556--73363739
67
2.8
64
78
8
203
30
17
28
22
1.97
73367574--73367609
19
1.9
19
88
5
56
44
0
11
44
1.39
73367989--73368196
67
3.2
64
74
10
170
32
16
28
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73373929--73374060
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3.3
40
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2
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26
28
21
23
1.99
73374045--73374122
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
73381781--73381912
40
3.3
40
86
2
176
26
28
21
23
1.99
73381897--73381974
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
73386341--73386380
21
1.9
21
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30
1.65
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8
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0
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0
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1.45
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7
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7
100
0
50
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0
28
28
1.55
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27
3.4
27
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28
23
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40
1.82
73393411--73393534
27
4.6
27
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42
22
7
27
1.80
73393411--73393611
54
3.7
54
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6
172
41
18
8
31
1.81
73393512--73393596
27
3.1
27
76
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91
40
15
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1.77
73394507--73394576
25
2.8
24
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86
25
25
22
25
2.00
73394507--73394603
25
4.0
23
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27
23
22
25
2.00
73394724--73394818
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2.3
42
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0
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158
25
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35
1.94
73396543--73396644
42
2.4
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25
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2.0
16
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0
55
56
34
0
9
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29
3.4
29
84
1
126
27
14
29
28
1.95
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39
2.9
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10
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26
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73406227--73406273
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2.3
20
82
10
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36
0
14
48
1.44
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49
4.9
49
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30
26
17
25
1.97
73408379--73408412
17
2.0
17
88
0
50
55
8
2
32
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73408611--73408670
30
2.0
30
83
6
77
28
26
6
38
1.81
73410566--73410604
15
2.5
15
91
4
60
56
15
12
15
1.68
73413343--73413587
49
4.9
49
80
4
285
29
26
19
25
1.98
73414237--73414294
30
1.9
30
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27
27
3
41
1.72
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50
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7
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27
18
24
30
1.98
73415117--73415450
150
2.2
150
87
3
474
27
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1.98
73415660--73415691
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16
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0
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0
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1.95
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2.1
54
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133
36
18
22
21
1.95
73421702--73421919
96
2.3
95
92
4
375
30
28
7
33
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356