Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  47  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15164984--15165056
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32
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2.0
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0
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2.2
21
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2.2
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0
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0
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25
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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61
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0
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21
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15293764--15293878
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96
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22
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11
70
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1.80
15298458--15298542
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2.0
24
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18
25
22
33
1.97
15301391--15301458
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2.0
201
100
0
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39
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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1.41
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2.7
23
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5
1
61
1.27
15303747--15303896
80
1.9
79
81
13
182
28
6
4
60
1.40
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9
7.6
9
73
18
52
64
1
4
29
1.22
15305396--15305467
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4.0
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1
4
31
1.23
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19
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9
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62
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45
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15357437--15357470
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18
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1.9
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9
65
52
0
0
47
1.00
15373663--15373721
22
2.6
22
78
10
57
45
0
1
52
1.10
15373791--15373821
16
1.9
16
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0
53
48
3
0
48
1.17
15374773--15374821
24
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24
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0
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20
16
22
1.91
15377635--15377659
2
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2
100
0
50
52
0
48
0
1.00
15377769--15377811
3
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3
90
0
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2
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32
1.71
15387410--15387551
69
2.1
69
93
0
239
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14
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27
1.95
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34
2.0
34
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5
111
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13
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39
1.64
15416137--15416181
22
2.0
22
91
0
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46
4
8
40
1.55
15417859--15417928
22
3.3
21
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20
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2
0
52
1.15
15417859--15417928
21
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22
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44
2
0
52
1.15
15418263--15418318
21
2.7
21
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28
1.87
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30
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1.79
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0
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1.18
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5.9
12
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0
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0
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1.20
15444535--15444609
18
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18
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0
105
22
0
9
68
1.18
15448357--15448382
6
4.3
6
100
0
52
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15
19
19
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.92
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0
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0
36
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2.0
45
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2.0
157
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52
2
0
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1.13
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52
0
0
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2.0
84
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0
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0
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1.43
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18
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17
0
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19
2.5
18
77
19
51
21
0
12
65
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15508559--15508592
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12
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0
50
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0
0
32
0.91
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2.1
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2
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9
20
30
1.84
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0
0
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0
0
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24
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0
1
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1.9
33
84
9
80
30
18
10
40
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356