Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  2  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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3.8
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50
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0
3
33
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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99
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12
302
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3
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2
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0
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18
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0
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20
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44
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26
23
22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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55
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0
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10
45
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
631904--631977
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2.1
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0
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14
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53
1.34
661363--661430
31
2.2
32
83
2
84
25
8
10
55
1.62
661393--661417
13
1.9
13
100
0
50
36
8
8
48
1.62
661870--661979
31
3.6
30
79
9
114
54
9
6
30
1.57
671573--671606
16
2.1
17
94
5
61
23
11
0
64
1.26
675658--675724
11
6.1
11
72
18
50
47
2
0
49
1.16
675652--675724
36
2.0
37
82
12
89
47
2
0
49
1.15
681704--681761
7
8.3
7
90
0
62
20
29
10
39
1.86
692322--692466
52
2.7
53
88
6
204
29
28
15
26
1.96
694983--695040
7
8.3
7
86
0
71
22
29
8
39
1.84
719124--719149
7
3.7
7
100
0
52
15
53
0
30
1.42
722415--722472
30
1.9
30
89
3
89
43
0
0
56
0.99
722565--722632
29
2.4
28
76
18
68
51
14
1
32
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
726198--726253
28
2.0
28
96
0
103
48
17
16
17
1.82
731651--731713
31
2.0
32
81
9
76
65
3
9
22
1.37
732788--732835
22
2.2
22
89
10
73
54
0
0
45
0.99
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26
1.9
24
87
8
69
64
6
0
29
1.18
738990--739037
21
2.3
22
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10
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60
4
0
35
1.16
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20
2.0
20
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5
62
55
0
0
45
0.99
739692--739726
16
2.2
17
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10
56
57
0
0
42
0.99
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2
12.5
2
100
0
50
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0
0
48
1.00
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2.7
20
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18
70
10
0
44
46
1.37
757366--757415
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
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21
2.4
22
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15
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33
17
0
49
1.47
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16
3.0
16
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3
51
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4
0
21
0.99
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33
2.1
32
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2
116
62
28
5
2
1.33
795955--795995
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
830338--830424
43
2.0
43
100
0
174
34
18
18
28
1.95
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48
3.1
48
88
0
224
29
24
7
38
1.83
838256--838382
42
3.0
42
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6
170
29
26
14
29
1.95
838341--838464
47
2.7
46
86
2
167
29
27
16
27
1.97
838489--838668
31
5.8
31
93
0
288
25
27
20
26
1.99
838644--838820
50
3.5
50
89
3
257
27
20
15
36
1.93
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39
3.2
39
88
1
115
24
28
22
25
2.00
844003--844095
39
2.4
39
96
0
168
21
29
23
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
851866--851996
39
3.4
39
93
0
217
22
29
22
25
1.99
861962--862028
34
1.9
35
87
3
100
44
14
8
31
1.76
870430--870489
28
2.2
26
82
11
68
61
1
1
35
1.16
878248--878278
15
2.1
15
93
0
53
22
32
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1.80
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29
2.1
28
78
9
66
55
15
6
23
1.64
883030--883110
31
2.7
29
74
12
74
55
12
6
25
1.60
897230--897283
26
2.1
27
83
10
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1
1
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1.20
902523--902547
2
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2
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0
50
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0
0
1.00
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20
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65
2
0
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1.05
905501--905546
22
2.1
22
84
8
58
43
2
2
52
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356