Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  75  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23554881--23554952
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1.93
23572881--23573483
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62
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12
3.4
12
83
6
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59
4
7
28
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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19
0
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2.2
20
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75
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29
2.4
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44
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18
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20
0
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40
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23634404--23634442
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0
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18
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1.50
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22
2.3
21
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22
0
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1.52
23634502--23634542
14
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59
19
2
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34
1.64
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1.9
21
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17
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156
2.6
151
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10
449
32
17
17
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23677700--23677728
13
2.1
14
93
6
51
44
0
3
51
1.18
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2
2
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0
28
48
1.51
23680375--23680422
15
3.3
15
82
5
62
18
0
35
45
1.50
23680370--23680419
22
2.3
21
82
3
64
22
0
32
46
1.52
23680411--23680451
14
2.9
15
85
7
59
19
2
43
34
1.64
23680404--23680443
21
1.9
21
84
0
53
15
2
42
40
1.60
23688995--23689027
11
3.1
11
91
4
50
30
0
6
63
1.18
23691943--23691994
16
3.2
16
68
10
52
53
13
9
23
1.68
23691749--23692155
204
2.0
203
98
0
787
40
20
13
25
1.89
23696045--23696076
5
6.4
5
92
0
55
59
0
3
37
1.13
23704948--23705004
25
2.2
25
79
11
62
24
26
0
49
1.51
23705101--23705198
40
2.6
38
77
8
101
29
25
19
25
1.98
23706528--23706568
20
2.0
20
85
0
55
31
17
19
31
1.95
23708077--23708160
40
2.1
40
97
0
159
27
3
13
55
1.54
23711355--23711417
29
2.2
28
77
5
72
19
17
3
60
1.49
23711444--23711522
28
2.9
28
81
5
90
20
15
8
55
1.66
23714001--23714029
11
2.6
11
100
0
58
58
17
24
0
1.38
23721267--23721297
12
2.6
12
100
0
62
83
0
6
9
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23721267--23721300
6
5.7
6
85
0
50
82
0
5
11
0.83
23723378--23723434
15
3.9
14
84
11
78
35
1
12
50
1.50
23723811--23723869
21
2.7
21
78
5
73
13
18
23
44
1.86
23724752--23724785
15
2.3
15
89
0
50
35
2
23
38
1.70
23725784--23725823
19
2.1
19
90
0
62
30
15
2
52
1.55
23727432--23727488
30
1.9
30
85
0
78
14
22
35
28
1.93
23729295--23729385
6
15.3
6
89
1
130
79
4
1
15
0.95
23729295--23729385
24
3.8
24
95
1
157
79
4
1
15
0.95
23730676--23730738
21
2.9
21
81
9
65
73
1
12
12
1.18
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26
2.4
27
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7
76
53
0
1
44
1.10
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22
3.2
24
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20
72
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2
0
42
1.13
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22
2.2
22
82
13
57
55
0
2
42
1.11
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15
2.9
15
76
10
52
32
0
6
60
1.23
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19
1.9
19
94
0
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70
0
29
0
0.88
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18
2.2
18
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0
53
40
10
12
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1.77
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15
2.9
15
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10
52
32
0
6
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1.23
23758304--23758330
6
4.5
6
100
0
54
18
18
14
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1.82
23763808--23763934
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2.8
46
82
5
152
17
22
16
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1.87
23763938--23764111
45
3.9
45
80
1
152
25
18
17
37
1.93
23764501--23764533
16
2.1
16
88
5
50
60
3
0
36
1.12
23773108--23773215
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
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1.83
23776568--23776645
26
3.3
23
76
15
70
53
3
2
39
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23777562--23777599
15
2.4
16
86
4
51
57
2
2
36
1.26
23782145--23782500
180
2.0
180
86
3
493
32
16
15
36
1.90
23785544--23785570
5
5.4
5
100
0
54
81
0
0
18
0.69
23794902--23794935
18
1.9
17
88
5
50
64
2
0
32
1.08
23796479--23796517
19
2.1
19
85
4
53
33
0
0
66
0.92
23796601--23796635
17
2.1
17
94
0
61
34
8
0
57
1.29
23796626--23796679
21
2.9
18
77
17
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31
1
3
62
1.23
23807258--23807309
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3.2
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2
59
50
11
11
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1.73
23807406--23807679
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15.4
16
73
13
116
46
10
12
31
1.75
23807239--23807679
18
25.1
17
72
12
234
45
10
11
32
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356