Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  279  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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0
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2.6
217
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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14
30
1.89
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195
2.6
196
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Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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29
1.69
91226803--91226904
30
3.4
30
84
2
134
44
3
22
29
1.71
91226900--91226936
15
2.4
16
90
4
58
24
0
2
72
0.97
91226902--91226936
16
2.2
16
89
0
52
20
0
2
77
0.90
91230387--91230819
45
9.7
45
76
6
315
30
20
22
26
1.98
91230612--91230784
92
1.8
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4
228
32
20
19
27
1.97
91232689--91232718
15
2.0
15
93
0
51
30
6
0
63
1.20
91233270--91233331
27
2.3
26
78
8
70
27
1
8
62
1.32
91236113--91236168
21
2.8
20
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55
5
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32
1.50
91237371--91237435
32
2.0
32
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0
121
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15
10
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1.81
91238607--91238643
15
2.4
16
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13
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5
0
72
1.04
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14
2.0
14
100
0
56
57
14
14
14
1.66
91245248--91245725
47
10.1
47
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2
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28
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10
20
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1.50
91252991--91253033
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3
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0
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0
0
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1.9
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12
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1.70
91257799--91257836
2
19.0
2
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0
67
2
47
0
50
1.15
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29
2.2
28
77
5
74
60
3
0
36
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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14
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25
2
3
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1.20
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19
2.6
19
80
6
55
70
18
10
0
1.15
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19
2.2
20
86
4
59
26
19
7
47
1.74
91275589--91275754
66
2.5
66
82
3
212
31
19
10
38
1.85
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45
2.3
45
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1
132
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16
23
32
1.96
91277072--91277134
15
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1.14
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16
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0
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2
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1.67
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28
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1.94
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0
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0
0
22
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3
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0
55
29
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29
1.78
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4.5
12
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0
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27
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27
1.79
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4.3
72
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2
405
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6
25
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18
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0
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13
32
1.82
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35
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3
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10
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1.63
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23
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15
1.82
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22
1.9
22
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0
75
30
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1.72
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20
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60
23
38
0
38
1.55
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2.1
13
100
0
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0
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1.40
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2.0
46
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0
162
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13
7
44
1.72
91313472--91313518
24
2.0
25
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8
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70
2
10
17
1.26
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21
2.6
21
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2
94
30
53
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12
1.55
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21
1.9
20
94
5
69
46
48
0
5
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91321226--91321290
33
2.0
33
85
11
89
27
6
0
66
1.15
91321247--91321289
15
2.9
15
78
21
54
30
4
0
65
1.13
91321254--91321304
21
2.4
21
87
12
70
29
7
0
62
1.23
91321235--91321299
33
1.9
33
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78
27
7
0
64
1.20
91327390--91327489
50
2.0
51
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2
148
21
27
23
29
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23
2.0
24
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33
6
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12.1
23
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142
29
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3
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1.32
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25
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4
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1.38
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19
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26
1
3
68
1.14
91345235--91345408
91
1.9
92
83
3
226
28
2
2
65
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356