Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  67  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
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Score
A
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(0-2)
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29
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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A
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(0-2)
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48
9
12
29
1.72
21443749--21443779
13
2.3
14
94
5
55
48
6
3
41
1.45
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14
2.9
15
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32
0
0
67
0.91
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0
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18
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15
2.1
15
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0
6
28
1.16
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39
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10
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21449483--21449546
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3.2
20
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20
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1.70
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26
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2.1
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259
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13
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1.90
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14
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14
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0
10
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20
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22
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22
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0
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18
1.80
21484237--21484401
27
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27
84
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221
33
23
24
18
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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54
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1.83
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29
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20
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1.91
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2.0
137
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21547960--21548067
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2.1
52
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23
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0
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10
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0
0
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1.9
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53
83
0
0
16
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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11
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1.34
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0
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0
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0
552
37
17
20
24
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356