Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  29  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9819717--9819829
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9819717--9819829
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27
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4
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2.3
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2.0
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18
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2.0
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59
0
0
40
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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3.8
8
90
0
51
43
0
33
23
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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18
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24
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20
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11
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0
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15
0
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10054323--10054393
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17
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26
0
2
71
1.00
10054453--10054668
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238
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15
40
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2.1
21
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0
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0
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0
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11
49
18
1.78
10067830--10067854
12
2.1
12
100
0
50
16
8
36
40
1.77
10068326--10068476
43
3.5
41
71
13
117
23
19
19
37
1.94
10091460--10091510
3
16.0
3
84
11
50
62
5
0
31
1.19
10091585--10091615
12
2.7
12
95
5
55
64
0
0
35
0.94
10094537--10094590
23
2.3
23
81
9
65
40
5
12
40
1.67
10094736--10094781
20
2.3
21
85
14
62
56
4
0
39
1.19
10101193--10101677
209
2.3
210
93
4
821
35
16
11
36
1.85
10107385--10107482
7
13.4
7
70
12
54
47
24
1
26
1.58
10107307--10107442
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1.9
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8
159
43
27
2
27
1.67
10107390--10107474
21
3.9
21
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17
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1
27
1.61
10107368--10107467
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46
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0
173
46
25
2
27
1.64
10107640--10107724
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2.1
40
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2
134
17
22
22
37
1.94
10116087--10116113
14
1.9
14
100
0
54
29
18
14
37
1.91
10116265--10116296
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5.3
6
100
0
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0
62
0
37
0.95
10118113--10118179
27
2.5
27
87
0
89
29
22
26
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10124784--10124900
59
2.0
60
89
1
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0
35
1.40
10125064--10125120
21
2.7
22
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0
24
0
75
0.80
10125061--10125111
20
2.5
20
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12
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0
21
0
78
0.75
10125067--10125120
18
3.0
17
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10
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0
25
0
74
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30
2.1
30
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0
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9
1
29
1.38
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19
2.0
20
89
5
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44
13
2
39
1.57
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19
2.2
20
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4
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50
9
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1.69
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13
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0
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12
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0
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6
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0
64
1.21
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3.8
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100
28
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1.27
10143338--10143454
58
2.0
58
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28
7
0
64
1.21
10143369--10143490
52
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28
7
0
63
1.21
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1.9
21
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0
0
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0
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2.1
19
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0
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2.0
21
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0
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2.5
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4
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5
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31
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3.0
46
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2
184
22
22
14
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10191932--10191972
21
2.0
21
100
0
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2
14
43
1.59
10192617--10192693
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2.0
39
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0
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25
23
27
23
2.00
10192618--10192709
39
2.4
39
88
1
132
27
22
27
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10194335--10194361
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
10195893--10195930
13
2.9
13
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11
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44
5
0
50
1.24
10200886--10200937
21
2.7
18
80
16
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3
1
21
1.10
10220006--10220081
21
3.6
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78
0
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22
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10
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1.81
10220045--10220112
21
3.3
21
77
4
59
16
17
17
48
1.81
10220057--10220112
21
2.8
21
75
5
62
17
17
17
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3
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0
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0
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3.2
15
73
19
50
46
0
0
53
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356