Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  278  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90929224--90929455
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49
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28
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25
1.97
90929211--90929451
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2.4
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2
324
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27
17
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1.98
90934112--90934170
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2.0
22
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0
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26
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30
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2.2
19
90
0
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17
31
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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28
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1.97
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3.6
178
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30
32
17
1.95
90970330--90971129
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1.95
90971033--90971294
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32
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1.97
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1.9
471
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19
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31
17
1.96
90971141--90971294
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21
1.97
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2.00
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24
2.00
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30
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4.5
125
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30
18
1.96
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3.5
167
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7
510
20
30
29
18
1.96
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4
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21
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16
1.95
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43
12.2
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278
22
32
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2.0
21
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0
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31
19
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1
154
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19
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1.9
163
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18
23
1.91
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15
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75
1
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1
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17
1.11
91010877--91010927
21
2.4
21
87
9
68
78
1
3
15
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91010904--91010933
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15
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51
80
0
6
13
0.91
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1
5
17
1.05
91010871--91010936
33
2.0
33
82
11
82
77
1
6
15
1.04
91017278--91017653
190
2.0
180
85
7
497
29
24
23
22
1.99
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50
3.8
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80
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189
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17
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1.98
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29
4.4
29
78
12
111
26
32
12
28
1.93
91029485--91029625
29
5.0
27
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14
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56
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6
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1.94
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145
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9
1532
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16
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1.94
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507
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15
2.0
17
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1.20
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25
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21
1.99
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24
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21
27
1.99
91067885--91068030
23
6.1
23
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21
27
1.99
91068077--91068127
20
2.5
20
93
0
84
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21
11
35
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91070186--91070223
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2.2
18
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4
69
5
0
36
57
1.21
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25
7.0
24
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27
22
21
27
1.99
91073064--91073209
23
6.1
23
85
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184
28
21
21
28
1.99
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20
2.5
20
93
0
84
31
21
11
35
1.90
91073343--91073390
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
91075350--91075430
40
2.0
40
82
4
99
7
2
39
50
1.44
91078218--91078385
25
7.0
24
84
8
191
27
22
21
27
1.99
91078239--91078384
23
6.1
23
85
7
184
28
21
21
28
1.99
91078431--91078481
20
2.5
20
93
0
84
31
21
11
35
1.90
91078518--91078565
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
91080542--91080575
17
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18
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5
61
5
0
32
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1.20
91082300--91082424
64
1.9
67
83
8
168
24
25
28
21
1.99
91083394--91083561
23
7.0
23
84
8
203
27
22
21
27
1.99
91083421--91083559
73
1.9
71
89
2
215
29
23
21
25
1.99
91083607--91083657
20
2.5
20
93
0
84
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21
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35
1.90
91083694--91083741
25
1.9
25
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0
69
25
16
25
33
1.96
91084902--91084979
27
2.9
27
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11
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21
19
21
37
1.95
91084998--91085235
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1.81
91085226--91085357
27
4.9
27
91
0
192
42
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31
1.77
91085201--91085457
54
4.7
54
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37
8
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35
1.80
91085110--91085461
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4.3
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7
239
35
7
19
37
1.81
91085346--91085452
27
4.0
27
84
4
128
31
10
19
38
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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34
9
17
39
1.82
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31
2.1
31
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0
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26
21
15
35
1.94
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25
7.0
23
85
9
214
26
23
21
28
1.99
91088413--91088581
49
3.5
47
85
8
216
26
23
21
28
1.99
91088435--91088580
23
6.1
23
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7
202
27
22
21
28
1.99
91088627--91088677
20
2.5
20
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0
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1.90
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27
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20
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1.96
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1.82
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3.2
26
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9
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1.81
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2.1
72
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0
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18
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1.94
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0
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0.90
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1.50
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2.4
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5
198
31
24
14
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1.94
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18
2.0
18
89
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56
18
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1.51
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2.0
75
100
0
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1.94
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27
2.8
28
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15
1.88
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4.7
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2
133
22
24
25
27
2.00
91123381--91123536
39
3.9
39
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1
159
21
23
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28
1.99
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21
2.3
21
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0
71
32
26
28
12
1.92
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114
2.0
113
95
0
409
37
17
11
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1.85
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57
2.4
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33
17
17
31
1.94
91143201--91143261
30
2.0
30
87
0
86
39
8
24
27
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91143685--91143950
46
5.7
46
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16
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22
20
27
29
1.98
91143731--91143899
47
3.6
47
75
13
204
23
19
27
30
1.98
91143682--91143945
93
2.8
93
94
0
465
22
20
27
29
1.99
91146925--91146986
15
4.2
15
80
10
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11
19
12
56
1.66
91148904--91148965
30
2.1
30
87
0
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8
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27
1.83
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46
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233
23
19
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29
1.98
91149434--91149602
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3.6
47
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179
24
18
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1.98
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92
91
2
438
23
19
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1.98
91162930--91163099
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3.5
49
86
4
222
30
28
15
25
1.96
91167722--91167780
9
5.9
9
81
16
64
37
13
0
49
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356