Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  159  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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20
28
1.98
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317
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28
19
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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40
5.7
40
89
3
343
26
26
21
24
2.00
51505704--51505760
23
2.4
23
80
8
62
15
24
19
40
1.90
51505898--51505936
20
2.0
20
89
0
60
30
7
20
41
1.80
51507606--51507783
96
1.9
96
80
0
212
30
22
24
22
1.99
51507604--51507787
48
3.9
47
72
7
156
29
21
25
23
1.99
51507986--51508250
94
2.8
96
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4
338
24
18
29
27
1.98
51507985--51508250
48
5.6
48
85
3
349
24
18
29
27
1.98
51516533--51516623
28
3.2
28
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4
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32
20
24
21
1.98
51516729--51516795
28
2.4
28
89
0
107
32
7
26
32
1.84
51519109--51519152
20
2.2
20
95
0
79
34
4
18
43
1.70
51523320--51523544
40
5.6
39
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5
308
22
22
28
26
1.99
51523320--51523544
120
1.9
120
88
3
346
22
22
28
26
1.99
51523802--51523845
22
2.0
21
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31
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13
36
1.90
51528401--51528528
29
4.5
28
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2
175
32
25
12
28
1.92
51528400--51528528
57
2.3
57
87
2
188
32
26
12
28
1.92
51534509--51534733
40
5.6
40
88
5
339
23
22
27
27
1.99
51534991--51535034
22
2.0
21
83
16
54
31
18
13
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51543566--51543726
22
7.1
22
79
8
139
25
22
17
34
1.95
51543602--51543726
44
2.8
44
86
4
153
27
22
16
34
1.95
51543900--51543977
20
3.9
19
80
6
75
38
11
12
37
1.80
51543900--51543999
40
2.5
40
80
9
116
39
11
13
37
1.79
51548360--51548389
16
1.9
16
93
6
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50
3
6
40
1.45
51549978--51550054
29
2.7
29
97
0
145
31
31
22
15
1.95
51562515--51562663
40
3.7
40
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194
28
27
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22
1.99
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28
19
31
20
1.97
51567776--51568029
94
2.7
94
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7
263
28
19
30
21
1.97
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40
5.6
40
82
4
263
22
27
24
25
2.00
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13
2.1
14
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6
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55
10
0
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1.34
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2.0
34
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0
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17
20
27
1.95
51587762--51588085
9
37.1
9
70
9
136
36
1
16
45
1.56
51587871--51587933
33
1.9
33
86
0
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33
3
14
49
1.59
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139
2.3
140
90
2
502
37
1
15
45
1.55
51588008--51588075
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2.1
33
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0
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33
1
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51587937--51588101
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1.9
88
86
3
237
37
1
15
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1.54
51591882--51592053
46
3.7
45
77
13
179
29
26
20
23
1.99
51591889--51592057
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1.8
93
90
0
275
28
27
20
23
1.99
51591884--51592073
46
4.1
45
71
16
138
29
26
20
23
1.99
51598978--51599070
29
3.2
30
77
7
86
26
29
12
31
1.93
51605647--51605691
22
2.0
23
82
4
56
62
6
4
26
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51606721--51606783
29
2.2
29
85
2
83
25
30
15
28
1.96
51606733--51606817
29
3.0
28
81
10
91
28
29
15
27
1.96
51613682--51613774
43
2.2
43
88
0
132
25
22
29
22
1.99
51617989--51618105
61
1.9
61
83
0
153
23
29
23
23
1.99
51620028--51620338
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8.0
39
92
0
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28
24
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1.99
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2.1
12
100
0
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24
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8
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1.84
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100
0
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1.93
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26
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0
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1.98
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20
2.0
20
100
0
82
39
14
4
41
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356