Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  180  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.1
22
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17
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2.6
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2.0
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58594547--58594613
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3.7
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4
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1.26
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9
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43
3
20
32
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.91
58609873--58610203
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163
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540
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15
28
1.91
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2.5
14
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0
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60
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20
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1.9
15
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1.70
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52
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28
15
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58620914--58620957
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2.0
23
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34
20
11
34
1.88
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21
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1.86
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0
0
63
0.95
58625670--58625731
30
2.1
30
90
0
97
61
6
3
29
1.37
58627320--58627349
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
58627316--58627378
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2.3
26
76
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63
38
0
11
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1.38
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10
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10
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4
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31
6
0
62
1.20
58632859--58632931
38
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0
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1.94
58634036--58634206
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28
1.99
58636570--58636689
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1.9
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163
51
7
7
33
1.58
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18
2.0
18
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0
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2.0
21
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25
1.76
58655570--58655784
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1.97
58655570--58655837
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23
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26
1.98
58660053--58660082
15
2.1
14
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0
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1.11
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2.0
42
87
0
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28
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28
1.95
58667080--58667112
13
2.6
13
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39
0
12
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1.40
58670293--58670332
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2.0
21
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40
10
2
47
1.50
58670374--58670502
49
2.7
47
83
8
170
41
6
1
50
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.7
46
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10
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22
20
27
29
1.98
58672716--58672887
93
1.8
93
90
2
274
23
20
27
27
1.99
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13
4.8
13
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4
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38
24
3
33
1.71
58677483--58677536
12
4.3
12
77
9
63
40
22
3
33
1.71
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21
3.0
21
90
2
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24
21
37
16
1.93
58681475--58681732
49
5.4
49
74
11
173
25
29
18
27
1.98
58683089--58683144
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2.7
21
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10
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21
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1.74
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19
2.5
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16
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1.89
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2.5
37
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0
173
23
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19
25
1.98
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47
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590
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30
12
30
1.92
58685577--58686015
147
3.0
145
91
2
688
26
30
12
30
1.92
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194
2.0
195
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2
640
26
29
12
30
1.93
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36
2.0
36
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0
137
46
15
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17
2.3
17
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30
0
20
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2.0
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108
25
21
26
25
2.00
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22
27
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1.99
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1.9
23
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13
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46
9
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13
1.75
58708729--58709002
40
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40
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365
27
23
26
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1.99
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2.2
39
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0
145
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24
25
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1.98
58712455--58712482
7
4.0
7
100
0
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14
0
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42
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2.3
20
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2
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1.69
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46
2.6
46
82
5
136
29
20
27
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58719350--58719565
49
4.6
47
80
8
217
26
18
27
26
1.98
58719350--58719565
93
2.3
93
83
7
251
26
18
27
26
1.98
58719210--58719520
49
6.6
48
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196
28
20
26
24
1.99
58726985--58727209
49
4.6
49
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274
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29
16
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1.96
58726997--58727076
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3.2
25
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1.91
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1.99
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24
30
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24
1.99
58737544--58737677
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2.9
46
76
5
153
23
20
29
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356