Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  181  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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2.8
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2.0
21
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2
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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17
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0
0
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58860451--58860535
11
7.4
11
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19
66
65
1
3
29
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58860451--58860532
24
3.4
23
74
14
76
65
1
3
29
1.17
58860451--58860535
35
2.3
36
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91
65
1
3
29
1.16
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9
7
19
1.46
58863503--58863538
18
2.0
18
89
10
56
38
0
0
61
0.96
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18
2.5
17
82
10
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0
2
31
1.04
58864755--58864810
18
2.9
18
76
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32
0
5
62
1.18
58872127--58872219
44
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45
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11
138
36
26
4
32
1.76
58872201--58872255
16
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16
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76
29
25
7
38
1.83
58873101--58873140
20
2.0
20
85
0
53
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22
1.82
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26
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4
2
56
1.30
58873549--58873620
21
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20
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1
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1.34
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15
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0
0
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1.96
58882249--58882313
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1.99
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22
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51
0
2
46
1.13
58897914--58897972
30
2.0
30
86
0
82
11
27
37
23
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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15
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18
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1
5
17
1.04
58899784--58899849
24
2.7
23
79
11
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77
1
6
15
1.04
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15
3.1
15
78
15
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2
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1.28
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32
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1.28
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47
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24
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1.97
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23
1.98
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2.00
58917386--58917569
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22
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2.00
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2.1
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26
21
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25
1.99
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2.3
81
84
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236
24
22
27
25
2.00
58925465--58925648
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4.6
40
83
9
216
24
22
27
25
2.00
58925517--58925681
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2.1
79
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210
26
21
27
25
1.99
58929984--58930024
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2.3
18
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1.79
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215
26
18
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25
1.98
58930986--58931204
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26
17
29
27
1.97
58930986--58931236
44
5.5
44
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9
256
25
17
29
27
1.97
58930943--58931236
140
2.1
139
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7
388
26
18
29
26
1.98
58941993--58942162
52
3.4
51
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4
247
27
30
13
28
1.94
58945536--58945636
45
2.2
45
87
6
143
22
11
29
35
1.90
58945612--58945748
44
2.9
44
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20
16
29
34
1.94
58949536--58949572
19
2.0
18
94
5
65
48
10
10
29
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58951795--58952003
55
3.9
53
77
8
215
33
17
25
23
1.96
58958215--58958262
21
2.3
21
96
0
87
31
22
35
10
1.88
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55
3.9
54
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217
34
17
24
23
1.95
58959547--58959747
108
1.8
110
86
4
291
34
17
24
23
1.96
58960712--58960870
27
5.9
27
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11
175
34
21
24
19
1.96
58960730--58960873
54
2.7
54
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2
236
34
22
24
18
1.96
58962467--58962574
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4.2
26
92
0
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28
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1.94
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52
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196
29
28
12
29
1.93
58965937--58966010
34
2.2
34
97
0
139
29
24
16
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356