Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   

This is table  206  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67410151--67410237
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29
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2.0
25
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30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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498
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117
35
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10
38
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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24
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1.98
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2.7
132
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1.97
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0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67617034--67617110
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72
4
9
12
1.25
67618745--67618827
11
7.4
11
74
9
69
71
4
9
14
1.29
67632396--67632435
18
2.2
18
86
4
53
12
27
0
60
1.33
67634329--67634425
30
3.2
30
75
2
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28
15
26
28
1.96
67636603--67636633
12
2.6
12
100
0
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25
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12
45
1.83
67636694--67636743
6
8.2
6
83
16
59
0
20
2
78
0.86
67636681--67636743
21
3.0
20
79
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63
1
19
1
77
0.93
67636683--67636753
37
1.9
37
86
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101
1
18
2
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67636681--67636754
27
2.8
26
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1
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2
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67639155--67639240
12
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12
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4
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16
1.24
67639180--67639239
28
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28
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0
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3
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1.20
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5
1.29
67639168--67639254
40
2.3
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1.27
67639218--67639291
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1.36
67640195--67640250
12
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12
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55
0
26
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1.43
67640297--67640330
18
1.9
18
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52
2
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8
1.47
67643781--67643834
14
3.9
14
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4
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24
12
0
62
1.30
67643781--67643834
27
2.0
27
96
0
99
24
12
0
62
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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2
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4
0.88
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10
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10
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3
58
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2
7
2
0.74
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48
2.2
47
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135
59
1
24
14
1.45
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20
2.3
20
85
0
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29
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1.91
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17
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15
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2
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1.27
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2.1
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0
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2
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1.96
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2.5
21
90
3
79
3
19
0
76
0.93
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21
2.2
21
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7
60
8
21
0
70
1.14
67665303--67665346
22
2.0
22
95
0
79
34
4
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25
1.76
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20
2.3
20
84
0
56
23
19
17
39
1.92
67671306--67671379
30
2.5
30
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8
80
22
20
18
37
1.94
67672980--67673013
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10
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2
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1
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18
2.7
18
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69
0
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30
3.1
27
80
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1
17
12
1.25
67674179--67674241
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1.9
33
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12
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55
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25
12
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67676018--67676071
20
2.7
20
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0
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20
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67676028--67676091
30
2.1
30
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94
21
20
18
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1.93
67676018--67676082
20
3.2
20
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26
21
15
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67677634--67677673
12
3.5
12
93
6
66
7
5
5
82
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67679839--67679905
21
3.1
21
82
4
71
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32
2
29
1.73
67684020--67684116
30
3.2
31
73
5
101
27
28
15
27
1.96
67684973--67685021
20
2.3
20
82
10
53
32
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21
3.0
21
88
2
90
30
3
33
33
1.74
67697873--67697933
20
3.1
19
82
17
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31
13
24
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1.93
67699065--67699109
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3.3
14
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48
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0
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0
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1.91
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31
21
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1.91
67724671--67724717
20
2.3
20
85
0
67
29
36
12
21
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356