Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  17  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Score
A
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150
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26
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5
60
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
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2.2
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6184667--6184695
13
2.3
13
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17
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34
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77
42
0
5
51
1.24
6222093--6222230
39
3.4
39
73
19
113
40
14
24
20
1.90
6222093--6222219
42
3.1
43
75
17
135
40
14
25
19
1.89
6222093--6222274
81
2.3
79
83
13
211
40
14
25
19
1.90
6222093--6222302
38
5.4
42
71
21
122
41
14
24
19
1.89
6223782--6223948
46
3.7
45
76
6
185
29
31
19
19
1.97
6223789--6223957
90
1.9
91
92
1
286
27
30
20
20
1.98
6225822--6225861
17
2.2
19
86
8
57
45
17
5
32
1.70
6238867--6238981
33
3.4
33
72
19
103
8
6
4
80
1.03
6238862--6238948
24
3.7
23
67
11
59
9
6
5
78
1.10
6238937--6238984
7
7.0
7
79
13
55
10
4
0
85
0.73
6238937--6238984
21
2.3
20
82
10
62
10
4
0
85
0.73
6238929--6238980
24
2.1
25
86
10
72
7
5
1
84
0.84
6250963--6251341
44
8.7
43
71
9
182
32
20
21
26
1.97
6251050--6251382
174
1.9
170
86
6
474
32
20
21
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6253060--6253090
3
10.3
3
92
0
53
32
3
0
64
1.09
6253195--6253219
12
2.1
12
100
0
50
40
0
8
52
1.31
6257456--6257502
22
2.2
21
96
3
85
55
0
12
31
1.38
6262488--6262519
2
16.0
2
100
0
64
50
0
50
0
1.00
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14
2.9
13
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13
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24
0
2
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0.96
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3
8.3
3
100
0
50
32
0
68
0
0.90
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46
5.0
46
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3
291
40
13
23
21
1.89
6274456--6274486
15
2.1
15
100
0
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0
6
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1.28
6282557--6282608
22
2.4
22
86
0
68
55
0
3
40
1.18
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12
2.7
13
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4
52
61
0
0
38
0.96
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5
6.0
5
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7
53
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0
0
19
0.71
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15
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17
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40
3
0
55
1.16
6283887--6283928
14
2.7
15
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16
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45
2
0
52
1.13
6287387--6287839
247
1.8
244
81
7
560
32
15
21
30
1.94
6288567--6288601
6
5.8
6
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0
61
62
17
17
2
1.44
6288985--6289032
25
1.9
25
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8
71
62
0
10
27
1.27
6291250--6291326
24
3.1
24
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3
73
55
9
5
29
1.53
6291490--6291538
22
2.3
22
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10
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65
2
6
26
1.27
6291576--6291703
25
4.8
25
71
19
98
57
3
5
33
1.37
6299812--6299865
27
2.0
26
82
10
65
53
3
0
42
1.18
6307644--6307706
27
2.3
26
91
2
99
15
69
0
14
1.18
6307790--6308788
494
2.0
494
99
0
1973
49
21
9
19
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6308957--6308996
6
6.8
6
91
5
64
0
17
0
82
0.67
6308947--6308996
18
2.8
17
85
11
64
2
16
2
80
0.91
6315546--6315597
23
2.2
24
79
3
61
53
1
1
42
1.23
6324802--6324832
14
2.2
14
100
0
62
22
35
22
19
1.96
6326247--6326275
15
1.9
15
100
0
58
34
10
0
55
1.34
6326312--6326345
13
2.6
13
85
0
50
52
2
0
44
1.16
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28
2.1
27
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105
26
7
7
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28
2.1
28
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6
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6
8
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1.59
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2.5
32
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2
124
46
7
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30
1.74
6331345--6331374
15
1.9
16
93
6
53
53
6
3
36
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356