Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  347  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111047720--111047774
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1.92
111047722--111047821
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121
14
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1.92
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2.2
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0
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2.6
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2.8
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2.0
97
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7
24
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
29
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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111186874--111186992
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0
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0
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48
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0
28
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111258395--111258456
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1.57
111262912--111262955
22
2.0
21
82
4
52
63
2
0
34
1.07
111263504--111263562
28
2.1
29
96
3
111
54
8
15
22
1.68
111263567--111263670
49
2.1
50
98
0
185
53
6
18
21
1.67
111264386--111264419
16
2.1
17
88
5
52
55
0
0
44
0.99
111272972--111273414
224
2.0
218
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17
14
35
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111284436--111284491
29
1.9
29
88
0
85
25
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1.70
111285951--111285993
9
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0
13
0
0.58
111289632--111289675
19
2.3
20
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7
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29
20
4
45
1.71
111289817--111289880
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2.2
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45
0
3
51
1.17
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27
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1
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1.33
111289800--111290096
114
2.7
110
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416
45
1
5
47
1.36
111291229--111291280
15
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15
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0
3
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20
2.5
20
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0
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10
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0
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0.82
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40
4.4
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5
256
30
28
20
20
1.98
111329800--111329977
82
2.2
80
87
4
259
30
28
20
20
1.98
111353001--111353034
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5
11
0
82
0.83
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234
2.2
229
89
2
779
30
10
16
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111353952--111354466
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2.2
234
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29
8
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45
1.76
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2.0
86
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28
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18
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1.73
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2.0
21
100
0
86
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1.48
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17
2.0
17
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0
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1.76
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54
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11
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1.79
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2.0
32
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0
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1.8
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1.68
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17
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1.90
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24
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15
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0
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1.9
129
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0
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17
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1.93
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2.2
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0
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1.88
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2.0
19
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1.9
18
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42
0
2
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19.7
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3
0
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1.03
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70
14
158
58
1
7
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1.38
111418905--111418979
23
3.4
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14
66
60
1
8
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1.34
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17
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1.40
111421536--111421605
23
3.0
22
77
10
68
31
11
15
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111422641--111422672
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2.0
16
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0
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31
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2.0
62
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0
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21
24
25
29
1.99
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1.9
37
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0
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1.91
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30
3.3
30
94
0
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26
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17
1.69
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5.7
25
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7
4
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111439486--111439635
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144
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1.47
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1.48
111439786--111439820
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2
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1.24
111448222--111448256
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2.1
17
94
0
61
45
11
17
25
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356