Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   

This is table  314  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101863016--101863048
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1.9
17
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2.0
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4.2
165
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708
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18
19
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2.1
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2.7
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4
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101886259--101886319
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2.0
86
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25
1.30
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0
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0
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3.0
20
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14
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35
0
1
63
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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24
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45
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1
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1.23
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2.2
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0
0
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1
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
41
1.28
101997645--101997676
15
2.1
15
100
0
64
18
18
56
6
1.62
101998149--101998746
82
7.3
83
85
4
743
23
20
24
31
1.98
101998144--101998751
122
5.0
122
86
5
735
22
20
24
32
1.98
101998149--101998746
204
2.9
203
84
5
760
23
20
24
31
1.98
101998910--101999754
132
6.4
131
92
1
799
30
26
16
27
1.97
101998923--101999721
351
2.3
351
93
0
1337
29
26
16
27
1.97
101999047--101999759
132
5.4
132
92
1
900
30
26
16
26
1.97
102006540--102006573
15
2.3
15
89
0
50
58
8
14
17
1.61
102006726--102006778
9
5.6
9
74
12
52
54
0
5
39
1.24
102007261--102007289
12
2.4
12
100
0
58
51
6
0
41
1.28
102008335--102008366
15
2.1
15
100
0
64
18
18
56
6
1.62
102008956--102008988
16
2.1
16
100
0
66
36
0
12
51
1.39
102009095--102009127
16
2.0
17
94
5
59
39
0
0
60
0.97
102011101--102011141
3
13.7
3
89
0
64
26
4
34
34
1.78
102011101--102011141
12
3.4
12
96
0
73
26
4
34
34
1.78
102024583--102024640
9
6.6
9
78
11
66
72
0
3
24
1.00
102024583--102024639
16
3.3
16
81
15
69
71
0
3
24
1.01
102024582--102024690
9
12.0
9
67
14
55
66
0
4
27
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102024582--102024690
19
6.0
18
71
16
73
66
0
4
27
1.17
102029329--102029377
11
4.5
11
86
0
62
26
8
2
63
1.34
102032750--102032820
16
4.4
16
87
0
97
35
4
28
32
1.76
102032806--102032894
44
2.0
46
89
8
139
31
5
25
37
1.79
102032797--102032910
44
2.7
40
76
20
115
31
4
26
37
1.76
102032967--102033017
26
2.0
26
88
3
77
39
1
7
50
1.42
102033069--102033143
12
6.8
11
72
22
52
53
1
0
45
1.08
102033081--102033143
12
5.4
12
75
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55
50
1
0
47
1.10
102035828--102035902
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1.9
39
100
0
150
38
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16
30
1.88
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2.0
80
87
3
236
27
22
18
31
1.97
102061338--102061392
20
2.7
21
77
11
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18
5
34
41
1.73
102075894--102075927
4
8.5
4
93
0
59
26
2
23
47
1.66
102082738--102082812
30
2.5
30
91
2
123
44
13
6
36
1.70
102083483--102083548
22
3.0
22
77
2
69
63
6
4
25
1.37
102114532--102114577
24
1.9
24
90
0
74
45
23
2
28
1.65
102115586--102115665
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1.9
42
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0
142
30
26
16
27
1.97
102120990--102121192
41
5.0
41
93
0
327
31
22
26
19
1.98
102121250--102121283
16
2.1
17
88
5
52
52
32
0
14
1.42
102121743--102121776
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
102124570--102124610
21
2.0
21
90
0
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29
21
29
19
1.98
102126515--102126548
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
102127401--102127480
7
11.3
7
72
11
56
73
2
0
23
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102127404--102127495
15
6.4
14
83
5
78
70
3
0
26
1.02
102127425--102127495
8
9.4
8
80
11
78
70
1
0
28
0.96
102127425--102127499
15
5.1
15
79
12
84
69
1
0
29
0.97
102127424--102127499
22
3.5
22
84
10
102
68
1
0
30
0.98
102127418--102127499
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11.3
7
80
7
92
70
1
0
28
0.95
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20
2.4
21
82
10
64
22
2
6
68
1.23
102138132--102138156
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2.1
12
100
0
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0
0
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0
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13
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20
1.91
102151435--102151660
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4.5
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1
328
34
15
23
26
1.95
102151636--102151751
31
3.7
31
88
0
160
26
18
28
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356