Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  354  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113463231--113463422
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12
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2.2
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225
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2.4
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2.9
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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2.5
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2.0
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132
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2.2
28
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81
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0
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50
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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4
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3.2
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68
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6
49
1.44
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2.5
120
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26
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26
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3.2
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76
6
159
29
15
28
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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25
25
21
27
2.00
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269
23
20
31
24
1.98
113562710--113562841
60
2.2
59
85
6
187
37
17
9
36
1.82
113564034--113564082
24
2.0
24
100
0
98
30
28
12
28
1.93
113565692--113565722
16
1.9
16
93
0
53
25
16
0
58
1.38
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15
3.6
15
74
15
54
28
6
0
66
1.15
113569846--113569982
3
45.0
3
81
5
150
32
6
0
60
1.22
113570065--113570102
20
1.9
20
100
0
76
26
2
5
65
1.27
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20
2.5
22
78
21
64
25
1
7
66
1.27
113570053--113570117
26
2.5
25
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11
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27
3
4
64
1.28
113570195--113570240
20
2.2
20
84
3
65
23
4
2
69
1.17
113572534--113572581
19
2.6
18
84
12
62
41
0
2
56
1.11
113572534--113572579
22
2.3
19
85
11
56
43
0
2
54
1.12
113576670--113576722
26
2.0
26
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0
97
54
16
16
11
1.70
113577376--113577408
11
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11
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18
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9
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1.40
113579840--113579864
13
1.9
13
100
0
50
24
16
8
52
1.70
113581281--113581416
51
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41
1.69
113583100--113583389
96
3.0
96
93
0
472
36
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33
12
1.87
113584296--113584431
51
2.7
51
78
0
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5
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1.68
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2.0
81
91
0
257
39
11
12
36
1.79
113585435--113585477
18
2.3
18
84
4
59
44
0
11
44
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
29
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0
96
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15
3
10
1.29
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21
2.0
21
100
0
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23
14
14
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73
1.9
73
94
2
248
45
12
9
32
1.74
113587366--113587649
94
3.0
94
91
2
471
40
10
12
37
1.77
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41
2.9
41
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1
200
26
26
20
26
1.99
113591964--113592130
84
2.0
84
92
0
280
31
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22
1.95
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47
2.0
47
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0
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1.93
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6
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2
16
0
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0.83
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1.9
28
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0
72
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9
3
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1.41
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1.9
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0
121
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1
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1.35
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19
2.5
19
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53
0
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1.41
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2.0
35
100
0
142
47
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16
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1.77
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2.1
32
91
2
109
34
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17
38
1.82
113613741--113613787
21
2.2
22
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3
78
21
19
38
21
1.94
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28
2.1
28
80
0
64
35
20
0
44
1.52
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1.9
254
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0
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14
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30
2.0
30
100
0
122
29
9
26
34
1.88
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14
2.3
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10
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32
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8
50
1.64
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2.0
25
84
8
64
30
0
12
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1.36
113637730--113637759
15
2.0
15
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0
51
63
6
3
26
1.35
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13
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52
17
0
11
70
1.16
113645436--113645471
4
9.2
4
87
6
56
50
22
0
27
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113648639--113648687
24
2.0
24
100
0
98
36
30
4
28
1.76
113649477--113649539
32
2.0
32
100
0
126
28
19
19
33
1.96
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3
100
0
68
0
32
0
67
0.91
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105
2.0
104
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277
52
13
18
15
1.75
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15
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15
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2
33
17
1.62
113663426--113663806
174
2.2
174
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5
475
33
8
18
39
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2.0
52
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0
197
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0
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29
21
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1.99
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192
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10
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1.89
113675381--113675552
75
2.4
73
83
8
217
33
23
11
31
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
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          353   354   355   356