Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  56  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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7
1
18
1.15
18383784--18383809
5
5.2
5
100
0
52
76
0
0
23
0.78
18384867--18384897
14
2.2
14
94
0
53
38
0
12
48
1.42
18388560--18388617
5
10.8
5
76
12
53
41
0
3
55
1.17
18388563--18388618
12
4.5
12
77
16
60
41
0
3
55
1.17
18388709--18388857
74
2.0
74
100
0
298
28
9
16
45
1.78
18390007--18390045
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
18390277--18390387
38
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72
5
100
23
18
27
30
1.98
18390534--18390574
19
2.2
19
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12
59
46
0
24
29
1.53
18394878--18395004
47
2.7
48
79
11
156
23
18
27
29
1.98
18396922--18396960
13
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13
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0
51
17
23
35
23
1.95
18397630--18397678
5
10.0
5
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18
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0
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18
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0
76
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6
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0
50
14
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5
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0.91
18409603--18409637
15
2.2
16
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5
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34
2
2
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1.26
18421105--18421145
21
2.0
21
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0
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29
21
29
19
1.98
18424344--18424414
23
3.2
23
70
24
62
52
9
1
36
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18426607--18426663
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15
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17
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50
3
0
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1.18
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13
2.1
13
100
0
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18
22
29
1.97
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14
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14
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0
70
33
3
7
54
1.46
18428186--18428219
9
3.8
9
100
0
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23
8
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1.86
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2.1
12
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0
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24
1.94
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2.0
15
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0
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0
0
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0
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18
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0
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25
1.97
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18
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5
1.78
18447860--18447973
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2.2
51
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0
210
24
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5
1.78
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18
2.2
18
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35
10
0
53
1.35
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2.5
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78
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8
0
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1.30
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2.3
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35
3
3
57
1.34
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20
4.7
20
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120
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1.51
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2.7
43
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132
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3.0
73
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13
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25
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22
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14
2.5
14
90
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17
20
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57
1.60
18464044--18464781
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8.3
89
89
5
1097
27
18
20
33
1.96
18464272--18464306
14
2.5
14
95
0
61
17
22
5
54
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18463959--18464781
178
4.7
178
88
5
1155
27
18
20
33
1.96
18464361--18464395
14
2.5
14
95
0
61
17
22
5
54
1.64
18463959--18464781
267
3.1
263
90
5
1195
27
18
20
33
1.96
18464450--18464484
14
2.5
14
95
0
61
17
22
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18466577--18466633
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2.2
26
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31
17
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2.2
18
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35
10
0
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0
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114
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22
2
14
60
1.47
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15
3.9
15
74
19
57
59
1
1
36
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356