Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  68  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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31
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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29
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1.86
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19
25
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209
2.9
209
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21
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19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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207
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18
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21721960--21722021
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29
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22
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21729873--21729936
31
2.0
32
87
3
94
48
14
17
20
1.81
21735163--21735214
25
2.1
25
85
7
70
34
7
15
42
1.75
21736708--21736771
16
3.9
17
71
6
60
75
0
23
1
0.90
21736705--21736773
6
11.3
6
73
17
54
73
0
24
1
0.91
21736704--21736775
23
3.0
22
73
22
74
70
0
27
1
0.95
21762049--21762427
88
4.3
87
66
16
238
29
17
23
29
1.97
21762144--21762567
90
4.7
89
71
12
303
31
16
22
29
1.96
21762217--21762295
41
1.9
41
84
0
104
31
16
21
30
1.95
21762125--21762563
135
3.3
135
71
11
432
31
16
21
30
1.96
21761992--21762464
133
3.5
133
73
10
478
28
17
23
29
1.97
21761990--21762618
268
2.3
268
93
0
1053
30
17
22
28
1.97
21762573--21762747
89
2.0
89
91
2
289
34
22
18
24
1.96
21762573--21762784
89
2.4
89
84
4
259
33
22
18
25
1.96
21764445--21764512
12
5.7
11
76
13
55
33
5
2
57
1.38
21764693--21764741
11
4.5
11
80
14
57
34
0
4
61
1.15
21764675--21764774
14
7.2
14
67
19
59
36
3
2
59
1.24
21764729--21764814
25
3.6
25
69
23
78
33
5
3
56
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21764711--21764814
45
2.2
45
80
12
113
33
4
2
58
1.34
21764983--21765017
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
21765082--21765133
26
2.0
26
84
0
68
28
9
3
57
1.48
21770836--21770871
17
2.2
16
90
5
54
41
2
2
52
1.30
21771267--21771305
17
2.4
17
82
4
53
76
5
2
15
1.06
21774429--21774498
37
1.9
36
88
8
106
41
0
2
55
1.14
21774575--21774624
23
2.1
24
85
3
66
44
2
2
52
1.24
21777095--21777304
33
6.4
33
78
2
199
29
22
11
36
1.90
21777124--21777304
65
2.8
64
77
7
202
31
20
11
35
1.89
21777297--21777417
29
4.4
29
78
14
148
24
28
12
34
1.92
21777307--21777410
51
2.0
51
90
0
163
25
26
14
33
1.94
21778863--21778932
21
3.3
21
85
0
77
41
21
11
25
1.86
21788962--21789060
17
5.6
17
88
7
144
38
12
13
36
1.81
21788954--21789060
35
3.0
35
95
4
187
38
11
14
36
1.81
21788962--21789060
18
5.6
18
90
4
157
38
12
13
36
1.81
21789539--21789604
17
3.9
17
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23
59
34
1
0
63
1.04
21789581--21789629
26
1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
21792625--21792683
27
2.3
25
77
8
64
69
0
25
5
1.09
21792890--21792975
40
2.2
40
82
0
100
65
8
2
24
1.32
21792969--21793027
28
2.1
29
87
3
84
62
0
6
30
1.21
21806641--21806711
32
2.3
30
77
15
74
40
7
0
52
1.29
21810461--21810555
46
2.0
47
84
6
122
50
1
3
45
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21812887--21812978
38
2.4
37
85
3
121
34
9
18
36
1.84
21816028--21816234
103
2.0
103
97
0
387
31
14
22
30
1.94
21817565--21817733
85
2.0
86
84
3
225
31
21
19
26
1.97
21819723--21819834
38
2.9
38
85
0
134
29
11
20
38
1.88
21841566--21841738
47
3.7
47
73
11
167
23
20
28
27
1.99
21841621--21841792
46
3.7
46
80
13
226
20
19
29
29
1.97
21841570--21841784
93
2.3
93
95
0
376
22
20
28
28
1.98
21872494--21872537
23
1.9
23
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9
63
45
13
2
38
1.56
21876057--21876108
23
2.4
22
87
6
70
38
19
5
36
1.76
21878326--21878390
29
2.3
30
92
7
109
32
10
6
50
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356