Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  25  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
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Score
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181
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22
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8764160--8764192
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45
1.46
8787272--8787368
48
2.0
48
100
0
194
47
10
6
36
1.63
8788899--8788955
20
2.9
19
84
5
69
47
3
7
42
1.47
8789915--8790023
41
2.7
41
80
4
123
30
16
20
33
1.94
8808584--8808896
156
2.0
157
98
0
610
30
23
15
30
1.95
8820490--8820571
43
1.9
43
90
5
130
46
12
8
32
1.72
8820859--8821014
77
2.0
77
100
0
312
33
11
23
31
1.90
8822925--8822958
17
2.0
17
94
0
59
61
0
2
35
1.11
8822936--8823003
34
2.1
34
81
13
81
63
1
7
27
1.30
8823170--8823210
9
4.7
9
82
14
50
63
0
0
36
0.95
8823153--8823242
23
3.8
24
73
19
66
58
4
1
35
1.25
8823176--8823212
14
2.7
14
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4
67
59
0
0
40
0.97
8823420--8823476
24
2.4
24
81
0
69
61
8
3
26
1.42
8836373--8836464
44
2.1
44
81
4
105
32
25
20
21
1.98
8837371--8837434
34
1.9
34
84
15
89
51
17
3
28
1.60
8837970--8838189
46
5.0
46
81
9
242
21
23
15
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8838104--8838179
38
2.0
38
97
0
143
23
22
18
35
1.96
8841040--8841080
17
2.4
17
92
8
66
0
21
4
73
1.02
8841114--8841168
3
18.7
3
81
10
69
60
1
0
38
1.08
8841114--8841169
11
4.8
11
83
14
60
58
1
0
39
1.08
8841114--8841169
16
3.6
16
85
2
78
58
1
0
39
1.08
8841282--8841334
21
2.3
23
75
21
58
52
3
0
43
1.19
8843884--8843933
16
3.0
17
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8
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54
0
4
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1.19
8844073--8844137
32
2.0
32
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0
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7
3
49
1.47
8844765--8845116
133
2.6
131
82
3
416
52
6
9
30
1.61
8845187--8845522
88
3.9
87
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12
330
38
16
9
36
1.80
8857080--8857130
25
2.0
25
92
0
84
37
17
5
39
1.74
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38
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4
217
13
23
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1.93
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16
3.8
16
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0
113
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1.86
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73
1.9
73
80
0
165
13
23
29
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1.93
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2.5
37
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7
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27
29
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20
1.98
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17
2.1
16
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5
50
2
14
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14
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0
0
51
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16
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6
53
30
0
20
50
1.49
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16
2.3
15
90
5
52
40
5
0
54
1.24
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19
2.0
19
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15
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54
2
0
43
1.14
8871401--8871457
23
2.4
23
91
2
96
50
22
17
8
1.73
8874015--8874052
14
2.4
17
87
12
55
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8875303--8875363
21
2.8
22
85
9
90
18
24
26
31
1.97
8875303--8875377
21
3.5
21
83
5
89
17
21
25
36
1.95
8876530--8876795
46
6.0
46
84
7
334
21
24
15
38
1.92
8876709--8876784
38
2.0
38
100
0
152
23
26
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1.97
8878921--8878968
11
4.2
11
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10
51
62
2
0
35
1.07
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2.2
24
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0
0
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2.1
30
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0
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2.0
27
85
0
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0
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0
0.51
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2.2
17
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0
56
89
0
10
0
0.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356